More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10400 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_10400  Mg chelatase-related protein  100 
 
 
497 aa  998    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000714945  unclonable  0.00000000192008 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1407  Mg chelatase, subunit ChlI  55.58 
 
 
499 aa  550  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0255781  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07030  Mg chelatase-related protein  54.25 
 
 
507 aa  489  1e-137  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0454781  normal  0.57484 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0701  Mg chelatase, subunit ChlI  46.89 
 
 
498 aa  430  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000913151  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  45.62 
 
 
509 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  45.2 
 
 
509 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  45.22 
 
 
509 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  44.91 
 
 
509 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  44.82 
 
 
509 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  43.87 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  42.8 
 
 
512 aa  396  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  43.11 
 
 
509 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  42.26 
 
 
510 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  41.03 
 
 
512 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  45.53 
 
 
505 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  43.73 
 
 
509 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  45.08 
 
 
510 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  45.92 
 
 
501 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  45.33 
 
 
508 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  42.86 
 
 
514 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  44.62 
 
 
504 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  45.04 
 
 
509 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  44.03 
 
 
513 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  42.57 
 
 
513 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  45.84 
 
 
497 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  44.09 
 
 
509 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  45.64 
 
 
485 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  43.08 
 
 
506 aa  383  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  41.83 
 
 
506 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  42.8 
 
 
509 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  43.68 
 
 
511 aa  385  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  42.77 
 
 
513 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  44.22 
 
 
512 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  44.71 
 
 
512 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  42.8 
 
 
507 aa  381  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  42.18 
 
 
513 aa  381  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  42.61 
 
 
513 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  43.9 
 
 
512 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  41.65 
 
 
512 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1349  Mg chelatase, subunit ChlI  44.42 
 
 
501 aa  379  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  39.38 
 
 
510 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  40.51 
 
 
512 aa  377  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  39.05 
 
 
512 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  42.77 
 
 
501 aa  375  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  42.83 
 
 
501 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  40.84 
 
 
506 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  40.67 
 
 
516 aa  374  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  44.29 
 
 
497 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  43.69 
 
 
506 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  45.15 
 
 
511 aa  372  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1676  Mg chelatase-like protein  40.08 
 
 
507 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  42.19 
 
 
520 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  38.92 
 
 
509 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  39.84 
 
 
511 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  43.89 
 
 
510 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  43.85 
 
 
509 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  43.03 
 
 
511 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  43.14 
 
 
506 aa  372  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  39.88 
 
 
507 aa  371  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  40.47 
 
 
516 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  40.76 
 
 
512 aa  370  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  43.82 
 
 
514 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  44.31 
 
 
502 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  40.04 
 
 
507 aa  370  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  44.74 
 
 
504 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  43.48 
 
 
507 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  42.94 
 
 
499 aa  368  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  42.91 
 
 
515 aa  369  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  40.44 
 
 
504 aa  366  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  39.22 
 
 
518 aa  364  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  42.15 
 
 
523 aa  364  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  42.89 
 
 
506 aa  363  4e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  43.52 
 
 
497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  43.2 
 
 
504 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1175  Mg chelatase, subunit ChlI  38.62 
 
 
499 aa  362  8e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  41.06 
 
 
506 aa  361  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  40.12 
 
 
518 aa  361  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  40.56 
 
 
512 aa  361  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  39.96 
 
 
518 aa  361  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  38.98 
 
 
518 aa  360  3e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  42.35 
 
 
513 aa  360  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  44.62 
 
 
496 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  45.66 
 
 
498 aa  360  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  42.48 
 
 
506 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  42.8 
 
 
505 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  44.69 
 
 
504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  42.15 
 
 
510 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  37.45 
 
 
509 aa  356  6.999999999999999e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  42.66 
 
 
510 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4338  Mg chelatase, subunit ChlI  41.67 
 
 
510 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91286  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  41.4 
 
 
505 aa  354  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  41.72 
 
 
496 aa  354  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  39.59 
 
 
530 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  40.85 
 
 
516 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  42.77 
 
 
512 aa  353  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5963  Mg chelatase, subunit ChlI  45 
 
 
525 aa  353  4e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  43.57 
 
 
502 aa  353  4e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  42.38 
 
 
505 aa  353  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  42.09 
 
 
511 aa  352  5.9999999999999994e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  40 
 
 
510 aa  351  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>