More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5916 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5916  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 
506 aa  981    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000357839  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09840  Mg chelatase-related protein  65.34 
 
 
503 aa  576  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12911  hypothetical protein  60.04 
 
 
503 aa  543  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000430198  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  58.45 
 
 
506 aa  534  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  57.23 
 
 
503 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  57.23 
 
 
503 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  57.23 
 
 
503 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  57.03 
 
 
502 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2203  Mg chelatase, subunit ChlI  57.71 
 
 
503 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869212  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2096  Mg chelatase, subunit ChlI  54.74 
 
 
502 aa  482  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0232  Mg chelatase, subunit ChlI  52.98 
 
 
507 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3122  Mg chelatase, subunit ChlI  57.65 
 
 
506 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00256613  normal  0.153243 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3585  Mg chelatase-related protein  53.66 
 
 
511 aa  443  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3414  Mg chelatase, subunit ChlI  50.58 
 
 
519 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0670  Mg chelatase-related protein  50.69 
 
 
514 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1319  Mg chelatase, subunit ChlI  52.39 
 
 
506 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3997  Mg chelatase, subunit ChlI  55.89 
 
 
506 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1408  Mg chelatase, subunit ChlI  53.91 
 
 
517 aa  430  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1549  Mg chelatase, subunit ChlI  54.12 
 
 
515 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1157  Mg chelatase, subunit ChlI  52.86 
 
 
530 aa  428  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2192  Mg chelatase subunit ChlI  50.49 
 
 
510 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81013  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2473  Mg chelatase, subunit ChlI  48.34 
 
 
514 aa  408  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0320382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1176  Mg chelatase, subunit ChlI  50.89 
 
 
509 aa  409  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  42.23 
 
 
510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  41.63 
 
 
508 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1479  Mg chelatase, subunit ChlI  52.07 
 
 
505 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136594  normal  0.0522815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  49.42 
 
 
517 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142573  decreased coverage  0.00119551 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0677  putative ATP-dependent serine protease  43.91 
 
 
511 aa  403  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147039  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10080  Mg chelatase-related protein  48.84 
 
 
514 aa  396  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121458  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3247  Mg chelatase, subunit ChlI  44.94 
 
 
528 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433317  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23660  Mg chelatase-related protein  50.68 
 
 
512 aa  394  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161437  normal  0.0784396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  44.44 
 
 
509 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0991  Mg chelatase, subunit ChlI  52.33 
 
 
518 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.655571  normal  0.0802867 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0638  Mg chelatase-like protein  38.77 
 
 
547 aa  387  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  42.83 
 
 
509 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  43.03 
 
 
509 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  47.53 
 
 
512 aa  382  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  47.53 
 
 
499 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  43.96 
 
 
509 aa  382  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  42.66 
 
 
509 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  42.66 
 
 
509 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  37.18 
 
 
509 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  39.01 
 
 
512 aa  375  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  42.15 
 
 
509 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  41.55 
 
 
509 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  40.63 
 
 
506 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  36.85 
 
 
507 aa  368  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  40.58 
 
 
514 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  40.94 
 
 
508 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  42.91 
 
 
520 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  40.2 
 
 
506 aa  365  1e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  39.13 
 
 
512 aa  365  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  39.76 
 
 
509 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  38.98 
 
 
513 aa  363  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  41.35 
 
 
504 aa  362  6e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  38.14 
 
 
511 aa  362  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  40.71 
 
 
513 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  40.43 
 
 
507 aa  360  3e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  42.8 
 
 
505 aa  359  6e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  38.34 
 
 
512 aa  358  9.999999999999999e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  44.02 
 
 
501 aa  355  6.999999999999999e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  41.3 
 
 
506 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  38.04 
 
 
512 aa  353  2.9999999999999997e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  40.08 
 
 
510 aa  352  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  37.26 
 
 
516 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  39.05 
 
 
513 aa  351  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  44.05 
 
 
512 aa  350  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  43.91 
 
 
500 aa  350  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  42.47 
 
 
513 aa  349  8e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  38.74 
 
 
512 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1349  Mg chelatase, subunit ChlI  43.54 
 
 
501 aa  348  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  38.92 
 
 
518 aa  347  3e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  38.82 
 
 
513 aa  347  3e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  38.79 
 
 
504 aa  347  3e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11150  Mg chelatase-related protein  47.88 
 
 
511 aa  347  3e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.038106  normal  0.404293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  39.29 
 
 
509 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  38.8 
 
 
516 aa  346  7e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  39.72 
 
 
508 aa  344  2e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  39.45 
 
 
518 aa  344  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  35.56 
 
 
512 aa  344  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  42.41 
 
 
505 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  42.51 
 
 
507 aa  342  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  42.6 
 
 
505 aa  341  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  42.12 
 
 
507 aa  341  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  40.67 
 
 
511 aa  341  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  43 
 
 
510 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  46.15 
 
 
506 aa  340  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  45.76 
 
 
497 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  36.88 
 
 
512 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0721  Mg chelatase-related protein  39.29 
 
 
502 aa  338  9.999999999999999e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.059866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  42.09 
 
 
510 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  35.11 
 
 
510 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  45.47 
 
 
504 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  45.24 
 
 
497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  46 
 
 
497 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4074  Mg chelatase, subunit ChlI  37.2 
 
 
514 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  33.46 
 
 
509 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  42.23 
 
 
507 aa  336  5e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0558  Mg chelatase, subunit ChlI  38.68 
 
 
518 aa  336  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  46.44 
 
 
504 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>