More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1319 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1319  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 		 506 aa  975    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1176  Mg chelatase, subunit ChlI  55.56 
 
 		 509 aa  484  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1479  Mg chelatase, subunit ChlI  56.1 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136594  normal  0.0522815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12911  hypothetical protein  53.49 
 
 		 503 aa  481  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000430198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3585  Mg chelatase-related protein  55.6 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3997  Mg chelatase, subunit ChlI  55.49 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1549  Mg chelatase, subunit ChlI  57.12 
 
 		 515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3414  Mg chelatase, subunit ChlI  52.99 
 
 		 519 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2473  Mg chelatase, subunit ChlI  52.25 
 
 		 514 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0320382  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  53.88 
 
 		 503 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1408  Mg chelatase, subunit ChlI  57.06 
 
 		 517 aa  462  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  53.88 
 
 		 503 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  53.88 
 
 		 503 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2192  Mg chelatase subunit ChlI  52.66 
 
 		 510 aa  461  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81013  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2203  Mg chelatase, subunit ChlI  52.5 
 
 		 503 aa  455  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869212  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0232  Mg chelatase, subunit ChlI  52.73 
 
 		 507 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23660  Mg chelatase-related protein  54.3 
 
 		 512 aa  449  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161437  normal  0.0784396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0670  Mg chelatase-related protein  52.32 
 
 		 514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5916  Mg chelatase, subunit ChlI  52.39 
 
 		 506 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000357839  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  52.3 
 
 		 506 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0991  Mg chelatase, subunit ChlI  53.19 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.655571  normal  0.0802867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1157  Mg chelatase, subunit ChlI  53.71 
 
 		 530 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  51.68 
 
 		 502 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2096  Mg chelatase, subunit ChlI  50.3 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  42.18 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  42.57 
 
 		 512 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09840  Mg chelatase-related protein  50.79 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3122  Mg chelatase, subunit ChlI  51.95 
 
 		 506 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00256613  normal  0.153243 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  40.7 
 
 		 510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0677  putative ATP-dependent serine protease  44.49 
 
 		 511 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  41.03 
 
 		 509 aa  405  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  45.36 
 
 		 509 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  45.36 
 
 		 509 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  44.77 
 
 		 509 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10080  Mg chelatase-related protein  49.9 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121458  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  44.34 
 
 		 509 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  42.63 
 
 		 516 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  49.5 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0638  Mg chelatase-like protein  38.77 
 
 		 547 aa  390  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  43.2 
 
 		 509 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  41.96 
 
 		 509 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  47.24 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  43.45 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3247  Mg chelatase, subunit ChlI  44.15 
 
 		 528 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433317  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  38.31 
 
 		 509 aa  389  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09250  Mg chelatase-related protein  47.83 
 
 		 534 aa  392  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  44.09 
 
 		 506 aa  385  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  44.49 
 
 		 512 aa  388  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  48.06 
 
 		 517 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142573  decreased coverage  0.00119551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  42.24 
 
 		 508 aa  385  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  42.58 
 
 		 509 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  38.93 
 
 		 512 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  42.46 
 
 		 507 aa  376  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  42.44 
 
 		 509 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  41.99 
 
 		 509 aa  378  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  45.36 
 
 		 520 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  46.23 
 
 		 497 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  42.26 
 
 		 506 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 510 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  42.69 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  42.13 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  45.76 
 
 		 512 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  44.49 
 
 		 507 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  44.38 
 
 		 505 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  39.77 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  41.96 
 
 		 508 aa  365  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  43.71 
 
 		 504 aa  363  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  40.9 
 
 		 513 aa  363  5.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  40.76 
 
 		 511 aa  363  5.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  38.46 
 
 		 504 aa  362  9e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  44.18 
 
 		 513 aa  362  9e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  38.2 
 
 		 507 aa  362  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  44.64 
 
 		 505 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  46.06 
 
 		 514 aa  360  3e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5201  putative ATP-dependent protease  41.83 
 
 		 506 aa  359  6e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1676  Mg chelatase-like protein  37.65 
 
 		 507 aa  359  7e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4133  putative ATP-dependent protease  41.83 
 
 		 506 aa  358  9e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.815544  normal  0.463834 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  46.09 
 
 		 504 aa  358  9e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4278  putative ATP-dependent protease  41.83 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  46.43 
 
 		 500 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  45.79 
 
 		 485 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0335  Mg chelatase, subunit ChlI  46.01 
 
 		 510 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  42.52 
 
 		 508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  45.76 
 
 		 497 aa  356  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11150  Mg chelatase-related protein  48.34 
 
 		 511 aa  356  6.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.038106  normal  0.404293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4182  putative ATP-dependent protease  42.23 
 
 		 506 aa  355  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03644  predicted bifunctional enzyme and transcriptional regulator  41.63 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4209  Mg chelatase, subunit ChlI  41.63 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  40.74 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  44.32 
 
 		 513 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4236  putative ATP-dependent protease  41.63 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250822  normal  0.127263 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  40 
 
 		 508 aa  354  2e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03593  hypothetical protein  41.63 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11947  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3983  putative ATP-dependent protease  41.63 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4110  putative ATP-dependent protease  42.03 
 
 		 506 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  42.23 
 
 		 506 aa  353  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4125  putative ATP-dependent protease  41.83 
 
 		 506 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4231  putative ATP-dependent protease  41.83 
 
 		 506 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  37.77 
 
 		 506 aa  353  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  39.8 
 
 		 512 aa  353  4e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>