More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3247 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3247  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 
528 aa  1051    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433317  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1176  Mg chelatase, subunit ChlI  49.03 
 
 
509 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3414  Mg chelatase, subunit ChlI  43.59 
 
 
519 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5916  Mg chelatase, subunit ChlI  44.94 
 
 
506 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000357839  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0670  Mg chelatase-related protein  45.98 
 
 
514 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12911  hypothetical protein  43.77 
 
 
503 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000430198  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1479  Mg chelatase, subunit ChlI  47.08 
 
 
505 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136594  normal  0.0522815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1549  Mg chelatase, subunit ChlI  46.85 
 
 
515 aa  375  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0232  Mg chelatase, subunit ChlI  45.35 
 
 
507 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  44.47 
 
 
502 aa  372  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  37.94 
 
 
510 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3585  Mg chelatase-related protein  44.89 
 
 
511 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1319  Mg chelatase, subunit ChlI  43.59 
 
 
506 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2203  Mg chelatase, subunit ChlI  44.15 
 
 
503 aa  363  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869212  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3997  Mg chelatase, subunit ChlI  45.14 
 
 
506 aa  361  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1157  Mg chelatase, subunit ChlI  44.3 
 
 
530 aa  361  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  45.17 
 
 
503 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  45.17 
 
 
503 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  45.17 
 
 
503 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0991  Mg chelatase, subunit ChlI  47.59 
 
 
518 aa  360  4e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.655571  normal  0.0802867 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23660  Mg chelatase-related protein  45.56 
 
 
512 aa  359  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161437  normal  0.0784396 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  41.17 
 
 
508 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  44.23 
 
 
517 aa  358  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142573  decreased coverage  0.00119551 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  43.7 
 
 
506 aa  357  3.9999999999999996e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2096  Mg chelatase, subunit ChlI  45.02 
 
 
502 aa  356  5e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1408  Mg chelatase, subunit ChlI  46.37 
 
 
517 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  40.93 
 
 
509 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0677  putative ATP-dependent serine protease  39.04 
 
 
511 aa  348  1e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09840  Mg chelatase-related protein  46.03 
 
 
503 aa  346  6e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  38.83 
 
 
516 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  40.12 
 
 
509 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3122  Mg chelatase, subunit ChlI  45.65 
 
 
506 aa  339  9e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00256613  normal  0.153243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  40.38 
 
 
508 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2192  Mg chelatase subunit ChlI  42.83 
 
 
510 aa  337  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81013  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  39.89 
 
 
513 aa  336  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  38.99 
 
 
506 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  37.28 
 
 
512 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  37.16 
 
 
509 aa  335  9e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10080  Mg chelatase-related protein  43.58 
 
 
514 aa  334  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121458  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2473  Mg chelatase, subunit ChlI  40.95 
 
 
514 aa  332  9e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0320382  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  39.96 
 
 
509 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  40.88 
 
 
509 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  40.15 
 
 
509 aa  331  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4074  Mg chelatase, subunit ChlI  37.67 
 
 
514 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0638  Mg chelatase-like protein  35.07 
 
 
547 aa  327  3e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  39.81 
 
 
509 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  38.18 
 
 
509 aa  326  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  42.2 
 
 
499 aa  325  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  39.45 
 
 
504 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  36.89 
 
 
509 aa  323  4e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  35.2 
 
 
510 aa  323  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  42.94 
 
 
512 aa  323  7e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  43.79 
 
 
512 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  41.15 
 
 
505 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  39.17 
 
 
509 aa  319  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  37.2 
 
 
512 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  42.6 
 
 
504 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  36.29 
 
 
507 aa  317  3e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  42.07 
 
 
512 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  41.56 
 
 
514 aa  317  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  44.07 
 
 
512 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  41.48 
 
 
512 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  39.15 
 
 
509 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  40 
 
 
512 aa  314  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  42.99 
 
 
500 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  38.57 
 
 
511 aa  312  9e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  39.92 
 
 
505 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0159  Mg chelatase, subunit ChlI  40.66 
 
 
511 aa  312  1e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00157888  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0335  Mg chelatase, subunit ChlI  41.52 
 
 
510 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  40.86 
 
 
501 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  34.58 
 
 
512 aa  310  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  36.4 
 
 
511 aa  310  5e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  38.94 
 
 
530 aa  310  5e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3140  Mg chelatase, subunit ChlI  42.74 
 
 
512 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  43.13 
 
 
512 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  39.09 
 
 
510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  37.45 
 
 
511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  36.55 
 
 
506 aa  307  3e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  37.45 
 
 
508 aa  307  4.0000000000000004e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  41.68 
 
 
512 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  36.14 
 
 
506 aa  306  7e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  41.39 
 
 
497 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  38.83 
 
 
520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  39.39 
 
 
515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  39.81 
 
 
497 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  37.79 
 
 
509 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  39.15 
 
 
511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  36.54 
 
 
513 aa  302  1e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  41.18 
 
 
512 aa  301  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  34.76 
 
 
506 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  40.51 
 
 
504 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  38.27 
 
 
510 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  34.01 
 
 
507 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  39.42 
 
 
510 aa  301  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  39.81 
 
 
507 aa  301  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1676  Mg chelatase-like protein  33.73 
 
 
507 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  35.03 
 
 
512 aa  300  4e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  37.64 
 
 
507 aa  300  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  42.71 
 
 
504 aa  299  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  35.94 
 
 
509 aa  299  9e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>