More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1642 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 
506 aa  982    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12911  hypothetical protein  62.82 
 
 
503 aa  587  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000430198  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  62.2 
 
 
503 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  62.2 
 
 
503 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2096  Mg chelatase, subunit ChlI  61.57 
 
 
502 aa  558  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  62.2 
 
 
503 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2203  Mg chelatase, subunit ChlI  59.68 
 
 
503 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869212  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5916  Mg chelatase, subunit ChlI  58.45 
 
 
506 aa  534  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000357839  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  60.12 
 
 
502 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09840  Mg chelatase-related protein  61.28 
 
 
503 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3585  Mg chelatase-related protein  53.55 
 
 
511 aa  451  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0232  Mg chelatase, subunit ChlI  52.4 
 
 
507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3414  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 
519 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1319  Mg chelatase, subunit ChlI  51.5 
 
 
506 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1479  Mg chelatase, subunit ChlI  51.49 
 
 
505 aa  436  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136594  normal  0.0522815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3122  Mg chelatase, subunit ChlI  54.31 
 
 
506 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00256613  normal  0.153243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1176  Mg chelatase, subunit ChlI  50.89 
 
 
509 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23660  Mg chelatase-related protein  51.37 
 
 
512 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161437  normal  0.0784396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2192  Mg chelatase subunit ChlI  50.7 
 
 
510 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81013  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3997  Mg chelatase, subunit ChlI  53.86 
 
 
506 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1408  Mg chelatase, subunit ChlI  53.35 
 
 
517 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1157  Mg chelatase, subunit ChlI  51.24 
 
 
530 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0670  Mg chelatase-related protein  49.61 
 
 
514 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1549  Mg chelatase, subunit ChlI  51.87 
 
 
515 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222105 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0638  Mg chelatase-like protein  41.18 
 
 
547 aa  409  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0677  putative ATP-dependent serine protease  43.16 
 
 
511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2473  Mg chelatase, subunit ChlI  47.65 
 
 
514 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0320382  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10080  Mg chelatase-related protein  49.52 
 
 
514 aa  403  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  48.92 
 
 
517 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142573  decreased coverage  0.00119551 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  42.91 
 
 
512 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  44.18 
 
 
510 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0991  Mg chelatase, subunit ChlI  50.78 
 
 
518 aa  395  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.655571  normal  0.0802867 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  41.81 
 
 
509 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  40.89 
 
 
516 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  45.4 
 
 
520 aa  388  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  47.33 
 
 
499 aa  383  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  42.94 
 
 
509 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  43.86 
 
 
509 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  43.58 
 
 
510 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  44.27 
 
 
504 aa  379  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  41.54 
 
 
508 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  41.59 
 
 
509 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  41.35 
 
 
514 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  41.59 
 
 
509 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3247  Mg chelatase, subunit ChlI  43.7 
 
 
528 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433317  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  43.16 
 
 
509 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  42.63 
 
 
509 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  42.44 
 
 
508 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  38.78 
 
 
512 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  46.29 
 
 
504 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  45.78 
 
 
497 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  46.84 
 
 
497 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  45.08 
 
 
505 aa  363  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  42.15 
 
 
509 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  41.97 
 
 
509 aa  363  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  42.52 
 
 
507 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  47 
 
 
514 aa  362  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3940  Mg chelatase, subunit ChlI  44.07 
 
 
508 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4016  Mg chelatase, subunit ChlI  44.07 
 
 
508 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  47.43 
 
 
497 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  42.29 
 
 
506 aa  360  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  41.98 
 
 
506 aa  360  4e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4042  Mg chelatase, subunit ChlI  43.68 
 
 
508 aa  360  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4135  Mg chelatase, subunit ChlI  43.68 
 
 
508 aa  359  8e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  39.8 
 
 
513 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  44.53 
 
 
500 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  41.7 
 
 
507 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  38.82 
 
 
511 aa  358  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  45.54 
 
 
510 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  47.23 
 
 
496 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  41.04 
 
 
516 aa  357  3.9999999999999996e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  41.34 
 
 
506 aa  356  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  45.62 
 
 
505 aa  355  7.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  43.34 
 
 
508 aa  355  8.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  42.52 
 
 
507 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  39.33 
 
 
509 aa  355  1e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  44.2 
 
 
508 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  45.88 
 
 
513 aa  355  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09250  Mg chelatase-related protein  45.11 
 
 
534 aa  354  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1349  Mg chelatase, subunit ChlI  45.65 
 
 
501 aa  354  2e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  42.44 
 
 
509 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3820  Mg chelatase, subunit ChlI  43.59 
 
 
508 aa  353  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  40.35 
 
 
513 aa  353  5e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  38.24 
 
 
512 aa  352  5.9999999999999994e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  48.04 
 
 
498 aa  352  7e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  42.75 
 
 
509 aa  352  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  42.55 
 
 
505 aa  352  8e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  39.22 
 
 
512 aa  351  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3624  Mg chelatase, subunit ChlI  43.39 
 
 
508 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  42.49 
 
 
506 aa  352  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  38.18 
 
 
510 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  42.44 
 
 
508 aa  350  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  40.47 
 
 
512 aa  351  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  38.9 
 
 
512 aa  350  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  40.78 
 
 
513 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  41.26 
 
 
506 aa  349  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  45.71 
 
 
501 aa  349  6e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  40.85 
 
 
518 aa  349  8e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  44.62 
 
 
507 aa  349  8e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0068  Mg chelatase-related protein  38.25 
 
 
501 aa  348  1e-94  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0853054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>