More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1157 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3585  Mg chelatase-related protein  76.6 
 
 
511 aa  704    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1157  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 
530 aa  1000    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0670  Mg chelatase-related protein  57.33 
 
 
514 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3414  Mg chelatase, subunit ChlI  55.98 
 
 
519 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0232  Mg chelatase, subunit ChlI  56.6 
 
 
507 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1408  Mg chelatase, subunit ChlI  58.37 
 
 
517 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1176  Mg chelatase, subunit ChlI  55.73 
 
 
509 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1549  Mg chelatase, subunit ChlI  59.81 
 
 
515 aa  475  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0991  Mg chelatase, subunit ChlI  58.17 
 
 
518 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.655571  normal  0.0802867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3997  Mg chelatase, subunit ChlI  56.95 
 
 
506 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1319  Mg chelatase, subunit ChlI  53.71 
 
 
506 aa  465  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1479  Mg chelatase, subunit ChlI  55.49 
 
 
505 aa  463  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136594  normal  0.0522815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12911  hypothetical protein  52.37 
 
 
503 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000430198  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23660  Mg chelatase-related protein  53.7 
 
 
512 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161437  normal  0.0784396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5916  Mg chelatase, subunit ChlI  52.67 
 
 
506 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000357839  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3122  Mg chelatase, subunit ChlI  55.15 
 
 
506 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00256613  normal  0.153243 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  50.19 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  50.19 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  51.63 
 
 
506 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  50.19 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09840  Mg chelatase-related protein  51.7 
 
 
503 aa  438  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2473  Mg chelatase, subunit ChlI  51.34 
 
 
514 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0320382  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 
502 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2203  Mg chelatase, subunit ChlI  50.47 
 
 
503 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869212  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  49.91 
 
 
517 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142573  decreased coverage  0.00119551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2192  Mg chelatase subunit ChlI  51.32 
 
 
510 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81013  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10080  Mg chelatase-related protein  49.81 
 
 
514 aa  404  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121458  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  40.15 
 
 
510 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1319  magnesium chelatase ChlI subunit  48.3 
 
 
514 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3247  Mg chelatase, subunit ChlI  45.06 
 
 
528 aa  399  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433317  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2096  Mg chelatase, subunit ChlI  48.24 
 
 
502 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  42.91 
 
 
510 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0677  putative ATP-dependent serine protease  41.03 
 
 
511 aa  392  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147039  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0638  Mg chelatase-like protein  38.69 
 
 
547 aa  389  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  40.65 
 
 
516 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  40.8 
 
 
509 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  42.15 
 
 
509 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  43.43 
 
 
513 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  42.53 
 
 
509 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  41.57 
 
 
506 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  46.21 
 
 
501 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  39.89 
 
 
512 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  41.38 
 
 
507 aa  376  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  46.67 
 
 
514 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  47.44 
 
 
499 aa  376  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  42.07 
 
 
509 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  36.97 
 
 
509 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  40 
 
 
508 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  42.78 
 
 
509 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  42.07 
 
 
509 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  41.49 
 
 
506 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  43.93 
 
 
509 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  41.87 
 
 
509 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  48.69 
 
 
504 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  41.11 
 
 
506 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  42.83 
 
 
509 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09250  Mg chelatase-related protein  45.69 
 
 
534 aa  367  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  42.97 
 
 
520 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  41.39 
 
 
508 aa  364  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  41.68 
 
 
509 aa  362  7.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  41.95 
 
 
504 aa  362  8e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  37.02 
 
 
510 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  42.07 
 
 
511 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  44.83 
 
 
512 aa  357  2.9999999999999997e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  46.29 
 
 
497 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  46.96 
 
 
496 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  44.08 
 
 
513 aa  355  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  42.23 
 
 
505 aa  355  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  46.95 
 
 
497 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  37.6 
 
 
512 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  35.38 
 
 
509 aa  353  4e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  44.57 
 
 
512 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  37.94 
 
 
504 aa  349  6e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  39.96 
 
 
516 aa  348  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  40.27 
 
 
513 aa  347  2e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  44.11 
 
 
497 aa  348  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  42.48 
 
 
508 aa  346  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5300  Mg chelatase, subunit ChlI  46.37 
 
 
496 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787159 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  40.84 
 
 
511 aa  345  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  36.61 
 
 
507 aa  344  2e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5149  Mg chelatase, subunit ChlI  46.5 
 
 
496 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  38.05 
 
 
514 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  37.67 
 
 
512 aa  344  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5239  magnesium chelatase subunit D/I family protein  46.5 
 
 
496 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  38.36 
 
 
513 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  43.16 
 
 
500 aa  343  5.999999999999999e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  37.21 
 
 
512 aa  342  1e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  41.87 
 
 
505 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  48.92 
 
 
498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  37.4 
 
 
512 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  37.48 
 
 
512 aa  340  5e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  44.85 
 
 
510 aa  340  5e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0194  Mg chelatase, subunit ChlI  44.84 
 
 
510 aa  339  8e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.511798  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  46.69 
 
 
501 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  43.08 
 
 
505 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11150  Mg chelatase-related protein  45.47 
 
 
511 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.038106  normal  0.404293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  37.6 
 
 
511 aa  337  3.9999999999999995e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3674  Mg chelatase, subunit ChlI  44.78 
 
 
507 aa  336  5.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.411855 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  43.11 
 
 
506 aa  336  7.999999999999999e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  39.14 
 
 
508 aa  335  1e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>