More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3997 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3997  Mg chelatase, subunit ChlI  100 
 
 
506 aa  958    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3585  Mg chelatase-related protein  58.87 
 
 
511 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12911  hypothetical protein  55.6 
 
 
503 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000430198  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3414  Mg chelatase, subunit ChlI  54.86 
 
 
519 aa  487  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1319  Mg chelatase, subunit ChlI  55.58 
 
 
506 aa  487  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0670  Mg chelatase-related protein  55.49 
 
 
514 aa  484  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1479  Mg chelatase, subunit ChlI  57.11 
 
 
505 aa  480  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136594  normal  0.0522815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0232  Mg chelatase, subunit ChlI  56.89 
 
 
507 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1157  Mg chelatase, subunit ChlI  57.9 
 
 
530 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1176  Mg chelatase, subunit ChlI  56.25 
 
 
509 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2203  Mg chelatase, subunit ChlI  54.8 
 
 
503 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869212  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1408  Mg chelatase, subunit ChlI  58.74 
 
 
517 aa  473  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  55.25 
 
 
503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  55.25 
 
 
503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  55.25 
 
 
503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1549  Mg chelatase, subunit ChlI  58.43 
 
 
515 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3122  Mg chelatase, subunit ChlI  57.14 
 
 
506 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00256613  normal  0.153243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23660  Mg chelatase-related protein  57.99 
 
 
512 aa  462  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161437  normal  0.0784396 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2473  Mg chelatase, subunit ChlI  53.62 
 
 
514 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0320382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5916  Mg chelatase, subunit ChlI  55.42 
 
 
506 aa  458  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000357839  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  53.09 
 
 
502 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  53.86 
 
 
506 aa  449  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09840  Mg chelatase-related protein  55.14 
 
 
503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2192  Mg chelatase subunit ChlI  53.45 
 
 
510 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81013  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  43.34 
 
 
510 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0991  Mg chelatase, subunit ChlI  56.31 
 
 
518 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.655571  normal  0.0802867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10080  Mg chelatase-related protein  51.37 
 
 
514 aa  420  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  41.87 
 
 
512 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  44.25 
 
 
509 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  50.59 
 
 
517 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142573  decreased coverage  0.00119551 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2096  Mg chelatase, subunit ChlI  51.81 
 
 
502 aa  412  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  44.05 
 
 
509 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  43.06 
 
 
509 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  46.18 
 
 
520 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  45.04 
 
 
508 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  45.01 
 
 
510 aa  395  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  45.76 
 
 
509 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0638  Mg chelatase-like protein  39.49 
 
 
547 aa  396  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  41.18 
 
 
516 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  39.76 
 
 
509 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  44.58 
 
 
513 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  49.4 
 
 
499 aa  392  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  45.58 
 
 
509 aa  393  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3247  Mg chelatase, subunit ChlI  45.58 
 
 
528 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433317  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  49.4 
 
 
510 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0677  putative ATP-dependent serine protease  43 
 
 
511 aa  393  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  44.81 
 
 
509 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  42.94 
 
 
509 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  49.31 
 
 
504 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  47.93 
 
 
501 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  46.08 
 
 
509 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  44.62 
 
 
509 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  48.13 
 
 
497 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  45.11 
 
 
507 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  41.35 
 
 
507 aa  383  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  39.02 
 
 
510 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  44.16 
 
 
504 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  44.16 
 
 
509 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  40.95 
 
 
506 aa  382  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  40.87 
 
 
508 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  45.83 
 
 
512 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  44.51 
 
 
507 aa  379  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  40.16 
 
 
506 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  44.14 
 
 
505 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  47.33 
 
 
497 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  46.44 
 
 
514 aa  375  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  43.55 
 
 
506 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  41.87 
 
 
506 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  41.06 
 
 
513 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4042  Mg chelatase, subunit ChlI  43.59 
 
 
508 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  49.55 
 
 
525 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  42.56 
 
 
530 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  46.44 
 
 
512 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  44.95 
 
 
513 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4016  Mg chelatase, subunit ChlI  43.59 
 
 
508 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4135  Mg chelatase, subunit ChlI  43.39 
 
 
508 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  46.14 
 
 
497 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  48.5 
 
 
504 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3940  Mg chelatase, subunit ChlI  43.59 
 
 
508 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47810  Mg chelatase-related protein  48.91 
 
 
498 aa  365  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  47.45 
 
 
496 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  43.94 
 
 
505 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  44.22 
 
 
507 aa  364  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  42.46 
 
 
506 aa  364  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4252  Mg chelatase, subunit ChlI  43.17 
 
 
516 aa  363  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  44.71 
 
 
507 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0597  Mg chelatase, subunit ChlI  50.2 
 
 
529 aa  363  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.974825  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  48.7 
 
 
506 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3639  Mg chelatase, subunit ChlI  44.07 
 
 
509 aa  362  6e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  47.11 
 
 
485 aa  362  1e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  40.99 
 
 
514 aa  361  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  40.67 
 
 
512 aa  362  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  45.33 
 
 
512 aa  362  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  37.7 
 
 
512 aa  362  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  39.01 
 
 
512 aa  361  2e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  42.54 
 
 
498 aa  361  2e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  42.35 
 
 
511 aa  361  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  42.18 
 
 
509 aa  361  2e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  44.31 
 
 
506 aa  360  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  47.25 
 
 
506 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>