More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23660 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_23660  Mg chelatase-related protein  100 
 
 
512 aa  985    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161437  normal  0.0784396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1479  Mg chelatase, subunit ChlI  69.94 
 
 
505 aa  632  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136594  normal  0.0522815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1176  Mg chelatase, subunit ChlI  67.52 
 
 
509 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1408  Mg chelatase, subunit ChlI  64.64 
 
 
517 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2473  Mg chelatase, subunit ChlI  57.37 
 
 
514 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0320382  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0677  putative ATP-dependent serine protease  47.85 
 
 
511 aa  475  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3414  Mg chelatase, subunit ChlI  53.77 
 
 
519 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3585  Mg chelatase-related protein  55.66 
 
 
511 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3997  Mg chelatase, subunit ChlI  57.59 
 
 
506 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1319  Mg chelatase, subunit ChlI  54.3 
 
 
506 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12911  hypothetical protein  52.46 
 
 
503 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000430198  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10080  Mg chelatase-related protein  53.89 
 
 
514 aa  455  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121458  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0670  Mg chelatase-related protein  52.24 
 
 
514 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0638  Mg chelatase-like protein  42.26 
 
 
547 aa  458  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1549  Mg chelatase, subunit ChlI  55.27 
 
 
515 aa  449  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  53.06 
 
 
503 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  53.06 
 
 
503 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  53.06 
 
 
503 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0232  Mg chelatase, subunit ChlI  51.98 
 
 
507 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  51.37 
 
 
506 aa  442  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2203  Mg chelatase, subunit ChlI  52.35 
 
 
503 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869212  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  50.68 
 
 
502 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1157  Mg chelatase, subunit ChlI  52.92 
 
 
530 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09840  Mg chelatase-related protein  51.37 
 
 
503 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0991  Mg chelatase, subunit ChlI  54.17 
 
 
518 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.655571  normal  0.0802867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5916  Mg chelatase, subunit ChlI  50.68 
 
 
506 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000357839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  44.55 
 
 
509 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2096  Mg chelatase, subunit ChlI  48.05 
 
 
502 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  43.36 
 
 
509 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09250  Mg chelatase-related protein  49.16 
 
 
534 aa  399  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3122  Mg chelatase, subunit ChlI  51.36 
 
 
506 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00256613  normal  0.153243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  38.63 
 
 
509 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  40.64 
 
 
512 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11150  Mg chelatase-related protein  53.55 
 
 
511 aa  394  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.038106  normal  0.404293 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  41.33 
 
 
516 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2192  Mg chelatase subunit ChlI  50.29 
 
 
510 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81013  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  42.19 
 
 
509 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  42.38 
 
 
509 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  40.39 
 
 
508 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  47.98 
 
 
517 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142573  decreased coverage  0.00119551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3247  Mg chelatase, subunit ChlI  45.56 
 
 
528 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433317  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  43 
 
 
513 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  40 
 
 
510 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  42.24 
 
 
509 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  37.89 
 
 
510 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  42.86 
 
 
509 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  44.2 
 
 
520 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  40.83 
 
 
513 aa  374  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  41.6 
 
 
509 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  47.12 
 
 
512 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  42.89 
 
 
504 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  40.55 
 
 
506 aa  370  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  45.63 
 
 
512 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  46.98 
 
 
504 aa  372  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  47.73 
 
 
499 aa  371  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  40.16 
 
 
506 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  43 
 
 
509 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  40.51 
 
 
509 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  40.46 
 
 
512 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  37.68 
 
 
512 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  37.17 
 
 
509 aa  368  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  40.04 
 
 
506 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  46.12 
 
 
500 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  37.1 
 
 
512 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  45.36 
 
 
510 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  44.49 
 
 
513 aa  363  3e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  38.4 
 
 
511 aa  363  4e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  39.11 
 
 
506 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  43.82 
 
 
511 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  38.28 
 
 
512 aa  362  1e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  39.46 
 
 
507 aa  361  2e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  39.45 
 
 
516 aa  361  2e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  46.08 
 
 
512 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  40.35 
 
 
513 aa  360  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  42.51 
 
 
510 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  40.71 
 
 
509 aa  360  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  46.08 
 
 
497 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  46.09 
 
 
501 aa  359  5e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  48.41 
 
 
502 aa  359  7e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  45.58 
 
 
510 aa  359  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  37.55 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  41.98 
 
 
508 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  46.71 
 
 
515 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  43.65 
 
 
512 aa  357  2.9999999999999997e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  48.33 
 
 
502 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0335  Mg chelatase, subunit ChlI  45.77 
 
 
510 aa  357  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  44.49 
 
 
497 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  38.36 
 
 
512 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  36.65 
 
 
504 aa  356  6.999999999999999e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  44.78 
 
 
505 aa  356  6.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1377  Mg chelatase, subunit ChlI  36.92 
 
 
519 aa  355  7.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000488427  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  44.68 
 
 
498 aa  355  8.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  41.62 
 
 
507 aa  355  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1815  Mg chelatase, subunit ChlI  46.06 
 
 
512 aa  355  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  40.59 
 
 
514 aa  354  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  42.35 
 
 
511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  36.38 
 
 
507 aa  353  4e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  45.51 
 
 
497 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0672  Mg chelatase, subunit ChlI  41.05 
 
 
518 aa  353  4e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2199  Mg chelatase, subunit ChlI  46.06 
 
 
512 aa  353  5e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>