More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11150 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_11150  Mg chelatase-related protein  100 
 
 
511 aa  988    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.038106  normal  0.404293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1408  Mg chelatase, subunit ChlI  52.51 
 
 
517 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23660  Mg chelatase-related protein  54.46 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161437  normal  0.0784396 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2473  Mg chelatase, subunit ChlI  47.87 
 
 
514 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0320382  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1176  Mg chelatase, subunit ChlI  49.13 
 
 
509 aa  396  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1479  Mg chelatase, subunit ChlI  50.68 
 
 
505 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136594  normal  0.0522815 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10080  Mg chelatase-related protein  48.85 
 
 
514 aa  382  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121458  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09840  Mg chelatase-related protein  51.08 
 
 
503 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  42.38 
 
 
508 aa  382  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  44.08 
 
 
509 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1319  Mg chelatase, subunit ChlI  48.54 
 
 
506 aa  379  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  42.88 
 
 
509 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12911  hypothetical protein  46.56 
 
 
503 aa  375  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000430198  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  39.11 
 
 
510 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  42.69 
 
 
509 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  41.73 
 
 
516 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09250  Mg chelatase-related protein  48.61 
 
 
534 aa  371  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0232  Mg chelatase, subunit ChlI  49.51 
 
 
507 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5916  Mg chelatase, subunit ChlI  48.84 
 
 
506 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000357839  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3414  Mg chelatase, subunit ChlI  45.4 
 
 
519 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1549  Mg chelatase, subunit ChlI  51.25 
 
 
515 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  42.18 
 
 
509 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  47.85 
 
 
501 aa  365  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  39.49 
 
 
510 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  42.55 
 
 
509 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3997  Mg chelatase, subunit ChlI  50.1 
 
 
506 aa  362  8e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  47.57 
 
 
503 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  47.57 
 
 
503 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  47.57 
 
 
503 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  46.75 
 
 
504 aa  360  3e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3122  Mg chelatase, subunit ChlI  48.64 
 
 
506 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00256613  normal  0.153243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  39.19 
 
 
512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  48.69 
 
 
506 aa  357  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2203  Mg chelatase, subunit ChlI  46.08 
 
 
503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869212  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  41.62 
 
 
509 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0670  Mg chelatase-related protein  47.22 
 
 
514 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  44.6 
 
 
497 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0677  putative ATP-dependent serine protease  40.77 
 
 
511 aa  355  8.999999999999999e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147039  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  41.09 
 
 
506 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  41.55 
 
 
509 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2096  Mg chelatase, subunit ChlI  45.69 
 
 
502 aa  351  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  45.33 
 
 
497 aa  349  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  42.08 
 
 
509 aa  348  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  41.09 
 
 
509 aa  347  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  40.04 
 
 
507 aa  346  5e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  38.18 
 
 
512 aa  346  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  43.76 
 
 
512 aa  346  7e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  44.27 
 
 
513 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0991  Mg chelatase, subunit ChlI  51.76 
 
 
518 aa  344  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.655571  normal  0.0802867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  41.19 
 
 
510 aa  344  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  42.8 
 
 
509 aa  343  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  40.35 
 
 
513 aa  343  5.999999999999999e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  40.47 
 
 
509 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  40.23 
 
 
513 aa  342  8e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  40.78 
 
 
504 aa  342  8e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  41.17 
 
 
520 aa  342  8e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3585  Mg chelatase-related protein  45 
 
 
511 aa  342  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  46.02 
 
 
502 aa  342  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  39.85 
 
 
508 aa  341  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  43.39 
 
 
500 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0136  Mg chelatase, subunit ChlI  40.55 
 
 
508 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  34.95 
 
 
509 aa  337  5e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  41.19 
 
 
511 aa  336  5e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  35.77 
 
 
509 aa  336  5e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0638  Mg chelatase-like protein  35.79 
 
 
547 aa  336  5e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1157  Mg chelatase, subunit ChlI  46.21 
 
 
530 aa  336  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  44.2 
 
 
497 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  43.66 
 
 
499 aa  335  7.999999999999999e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  42.33 
 
 
506 aa  335  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  40.16 
 
 
508 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  38.75 
 
 
506 aa  335  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  39.19 
 
 
509 aa  334  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  41.31 
 
 
505 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  40.19 
 
 
508 aa  333  4e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  40.04 
 
 
513 aa  333  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  42.22 
 
 
498 aa  333  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  45.21 
 
 
517 aa  333  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142573  decreased coverage  0.00119551 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  42.83 
 
 
512 aa  333  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  39.96 
 
 
512 aa  333  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  43.5 
 
 
511 aa  332  1e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  36.61 
 
 
506 aa  331  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  41.15 
 
 
505 aa  331  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  38.64 
 
 
501 aa  331  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2192  Mg chelatase subunit ChlI  44.36 
 
 
510 aa  331  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81013  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  42.33 
 
 
506 aa  331  2e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  43.32 
 
 
496 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  38.67 
 
 
506 aa  330  3e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  37.98 
 
 
512 aa  330  3e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  38.67 
 
 
501 aa  330  4e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  44.08 
 
 
514 aa  330  5.0000000000000004e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  38.27 
 
 
512 aa  329  9e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  42.56 
 
 
501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  42.22 
 
 
507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  44.15 
 
 
504 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  39.08 
 
 
514 aa  326  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3688  Mg chelatase, subunit ChlI  43.82 
 
 
504 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  41.22 
 
 
517 aa  325  9e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  36.35 
 
 
506 aa  325  1e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  40.54 
 
 
511 aa  325  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  38.58 
 
 
530 aa  324  2e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>