More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3585 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1157  Mg chelatase, subunit ChlI  76.6 
 
 		 530 aa  689    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3585  Mg chelatase-related protein  100 
 
 		 511 aa  974    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3414  Mg chelatase, subunit ChlI  56.78 
 
 		 519 aa  508  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0670  Mg chelatase-related protein  58.01 
 
 		 514 aa  504  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1176  Mg chelatase, subunit ChlI  56.41 
 
 		 509 aa  491  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3997  Mg chelatase, subunit ChlI  58.89 
 
 		 506 aa  488  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0232  Mg chelatase, subunit ChlI  56.61 
 
 		 507 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1319  Mg chelatase, subunit ChlI  55.34 
 
 		 506 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1408  Mg chelatase, subunit ChlI  59.02 
 
 		 517 aa  480  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1549  Mg chelatase, subunit ChlI  60.7 
 
 		 515 aa  481  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12911  hypothetical protein  54.01 
 
 		 503 aa  476  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000430198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1479  Mg chelatase, subunit ChlI  56.7 
 
 		 505 aa  471  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136594  normal  0.0522815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0991  Mg chelatase, subunit ChlI  56.4 
 
 		 518 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.655571  normal  0.0802867 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  53.16 
 
 		 506 aa  462  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  52.37 
 
 		 503 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  52.37 
 
 		 503 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  52.37 
 
 		 503 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5916  Mg chelatase, subunit ChlI  53.66 
 
 		 506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000357839  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23660  Mg chelatase-related protein  55.66 
 
 		 512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161437  normal  0.0784396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3122  Mg chelatase, subunit ChlI  59.21 
 
 		 506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00256613  normal  0.153243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2473  Mg chelatase, subunit ChlI  52.62 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0320382  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09840  Mg chelatase-related protein  52.67 
 
 		 503 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  51.57 
 
 		 502 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2203  Mg chelatase, subunit ChlI  51.57 
 
 		 503 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869212  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2192  Mg chelatase subunit ChlI  52.33 
 
 		 510 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81013  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1319  magnesium chelatase ChlI subunit  50.1 
 
 		 514 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10080  Mg chelatase-related protein  50.1 
 
 		 514 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2096  Mg chelatase, subunit ChlI  49.9 
 
 		 502 aa  398  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  39.88 
 
 		 510 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0677  putative ATP-dependent serine protease  41.41 
 
 		 511 aa  393  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  49.61 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142573  decreased coverage  0.00119551 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  42.09 
 
 		 512 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  42.07 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  42.06 
 
 		 509 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  38.49 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  44.14 
 
 		 509 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  41.27 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  43.06 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  45.21 
 
 		 513 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  46.65 
 
 		 501 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  43.25 
 
 		 510 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3247  Mg chelatase, subunit ChlI  44.55 
 
 		 528 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433317  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  42.26 
 
 		 509 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0638  Mg chelatase-like protein  37.04 
 
 		 547 aa  379  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  44.16 
 
 		 509 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  48.92 
 
 		 504 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  48.57 
 
 		 499 aa  372  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  43.22 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  42.24 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  41.73 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  43.68 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  41.54 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  42.77 
 
 		 509 aa  368  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  46.17 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  39.76 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  46.73 
 
 		 512 aa  363  4e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  47.44 
 
 		 496 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  42.18 
 
 		 509 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  45.91 
 
 		 514 aa  362  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  42.57 
 
 		 509 aa  360  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  37.67 
 
 		 510 aa  360  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  42.18 
 
 		 508 aa  360  4e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  42.18 
 
 		 509 aa  359  8e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  41.78 
 
 		 511 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 510 aa  356  5.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  41.08 
 
 		 514 aa  355  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  45.56 
 
 		 497 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  47.07 
 
 		 497 aa  353  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  39.48 
 
 		 512 aa  353  5.9999999999999994e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  36.83 
 
 		 512 aa  352  8e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  35.8 
 
 		 509 aa  351  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  38.59 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09250  Mg chelatase-related protein  45.66 
 
 		 534 aa  350  2e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  41.39 
 
 		 509 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  41.3 
 
 		 516 aa  350  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3777  Mg chelatase, subunit ChlI  41.98 
 
 		 508 aa  350  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  43.67 
 
 		 505 aa  349  8e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  40.73 
 
 		 508 aa  349  8e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5239  magnesium chelatase subunit D/I family protein  47.27 
 
 		 496 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  47.55 
 
 		 497 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  43.64 
 
 		 505 aa  347  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  43.39 
 
 		 507 aa  346  5e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5149  Mg chelatase, subunit ChlI  47.07 
 
 		 496 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  41.6 
 
 		 518 aa  345  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  43.35 
 
 		 507 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  41.98 
 
 		 508 aa  344  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  37.82 
 
 		 512 aa  344  2.9999999999999997e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  43.37 
 
 		 512 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  39.33 
 
 		 511 aa  344  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  45.81 
 
 		 485 aa  343  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  38.34 
 
 		 512 aa  343  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5300  Mg chelatase, subunit ChlI  46.94 
 
 		 496 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787159 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  40.43 
 
 		 513 aa  342  1e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  35.57 
 
 		 507 aa  342  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  43.27 
 
 		 507 aa  341  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11150  Mg chelatase-related protein  44.94 
 
 		 511 aa  340  4e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.038106  normal  0.404293 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  45.01 
 
 		 506 aa  340  4e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  43.17 
 
 		 505 aa  340  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0460  Mg chelatase, subunit ChlI  45.33 
 
 		 506 aa  339  7e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000368524  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  46.82 
 
 		 506 aa  338  9e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>