More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1319 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1319  magnesium chelatase ChlI subunit  100 
 
 
514 aa  999    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3585  Mg chelatase-related protein  50.4 
 
 
511 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1157  Mg chelatase, subunit ChlI  48.11 
 
 
530 aa  392  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0670  Mg chelatase-related protein  44.4 
 
 
514 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3414  Mg chelatase, subunit ChlI  43.46 
 
 
519 aa  352  7e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0232  Mg chelatase, subunit ChlI  43.77 
 
 
507 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1549  Mg chelatase, subunit ChlI  46.82 
 
 
515 aa  342  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1319  Mg chelatase, subunit ChlI  43.5 
 
 
506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12911  hypothetical protein  42.09 
 
 
503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000430198  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1176  Mg chelatase, subunit ChlI  43.53 
 
 
509 aa  329  6e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5916  Mg chelatase, subunit ChlI  43.03 
 
 
506 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000357839  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  41.19 
 
 
506 aa  324  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3997  Mg chelatase, subunit ChlI  43.88 
 
 
506 aa  317  5e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  41.78 
 
 
503 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  41.78 
 
 
503 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  41.78 
 
 
503 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0991  Mg chelatase, subunit ChlI  44.99 
 
 
518 aa  316  8e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.655571  normal  0.0802867 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3247  Mg chelatase, subunit ChlI  38.79 
 
 
528 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433317  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2203  Mg chelatase, subunit ChlI  41.57 
 
 
503 aa  312  9e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869212  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  42.55 
 
 
499 aa  311  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09840  Mg chelatase-related protein  42.88 
 
 
503 aa  310  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1408  Mg chelatase, subunit ChlI  43.16 
 
 
517 aa  309  6.999999999999999e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  35.22 
 
 
512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0677  putative ATP-dependent serine protease  36.58 
 
 
511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2473  Mg chelatase, subunit ChlI  41.2 
 
 
514 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0320382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  37.03 
 
 
509 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1479  Mg chelatase, subunit ChlI  41.03 
 
 
505 aa  302  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136594  normal  0.0522815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  36.05 
 
 
516 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  34.78 
 
 
510 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  40.12 
 
 
502 aa  300  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  32.02 
 
 
509 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23660  Mg chelatase-related protein  42.47 
 
 
512 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161437  normal  0.0784396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3122  Mg chelatase, subunit ChlI  42.83 
 
 
506 aa  293  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00256613  normal  0.153243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  36.77 
 
 
509 aa  290  6e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  36.92 
 
 
509 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  36.25 
 
 
509 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  36.05 
 
 
509 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  37.65 
 
 
509 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  36.71 
 
 
509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  35.36 
 
 
509 aa  286  9e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  36.35 
 
 
506 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  35.06 
 
 
508 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  35.56 
 
 
509 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2096  Mg chelatase, subunit ChlI  40.24 
 
 
502 aa  283  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10080  Mg chelatase-related protein  39.73 
 
 
514 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  36.03 
 
 
509 aa  281  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2192  Mg chelatase subunit ChlI  39.38 
 
 
510 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81013  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  40.08 
 
 
517 aa  279  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142573  decreased coverage  0.00119551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  32.74 
 
 
510 aa  279  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  38.64 
 
 
501 aa  276  6e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  37.55 
 
 
505 aa  276  9e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  33.2 
 
 
512 aa  274  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  38.16 
 
 
514 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  32.56 
 
 
501 aa  273  7e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  32.56 
 
 
501 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0638  Mg chelatase-like protein  32.18 
 
 
547 aa  271  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  36.25 
 
 
510 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  37.32 
 
 
520 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  35.2 
 
 
508 aa  266  8e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  35 
 
 
507 aa  266  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  31.34 
 
 
506 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  34.86 
 
 
506 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  38.29 
 
 
513 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  34.18 
 
 
513 aa  265  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  35.02 
 
 
506 aa  264  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  31.4 
 
 
504 aa  263  4.999999999999999e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  36.14 
 
 
512 aa  263  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  35.43 
 
 
513 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  35.34 
 
 
504 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11150  Mg chelatase-related protein  40.5 
 
 
511 aa  261  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.038106  normal  0.404293 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  30.08 
 
 
509 aa  259  8e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  33.27 
 
 
516 aa  259  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  33.01 
 
 
512 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  39.59 
 
 
510 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  36.35 
 
 
510 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  37.94 
 
 
510 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3748  Mg chelatase, subunit ChlI  36.36 
 
 
505 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224013  unclonable  0.0000162445 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  28.96 
 
 
507 aa  252  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  37.23 
 
 
512 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0788  Mg chelatase, subunit ChlI  36.48 
 
 
511 aa  250  4e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  30.91 
 
 
506 aa  249  6e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  38.37 
 
 
504 aa  249  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  33.2 
 
 
508 aa  249  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  35 
 
 
511 aa  249  9e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  34.77 
 
 
514 aa  249  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  38.29 
 
 
497 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  35.5 
 
 
507 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  33.06 
 
 
518 aa  247  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  31.71 
 
 
512 aa  247  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1135  Mg chelatase, subunit ChlI  36.61 
 
 
505 aa  247  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00125802  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0335  Mg chelatase, subunit ChlI  35.74 
 
 
510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  35.77 
 
 
500 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  36.9 
 
 
509 aa  244  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  35.83 
 
 
510 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  35.69 
 
 
512 aa  243  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  38.21 
 
 
496 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  34.79 
 
 
506 aa  242  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  36.64 
 
 
511 aa  241  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  38.5 
 
 
525 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0521  competence-related protein  37.47 
 
 
506 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.381735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>