More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0670 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0670  Mg chelatase-related protein  100 
 
 
514 aa  1011    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0232  Mg chelatase, subunit ChlI  65.76 
 
 
507 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3414  Mg chelatase, subunit ChlI  61.2 
 
 
519 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0991  Mg chelatase, subunit ChlI  58.41 
 
 
518 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.655571  normal  0.0802867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1157  Mg chelatase, subunit ChlI  57.33 
 
 
530 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3585  Mg chelatase-related protein  58.01 
 
 
511 aa  501  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1176  Mg chelatase, subunit ChlI  54.72 
 
 
509 aa  490  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1549  Mg chelatase, subunit ChlI  58.09 
 
 
515 aa  483  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222105 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12911  hypothetical protein  51.08 
 
 
503 aa  472  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000430198  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3997  Mg chelatase, subunit ChlI  54.71 
 
 
506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1479  Mg chelatase, subunit ChlI  52.25 
 
 
505 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.136594  normal  0.0522815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1966  Mg chelatase, subunit ChlI  51.67 
 
 
503 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352304  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1986  Mg chelatase-related protein  51.67 
 
 
503 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0373597  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1319  Mg chelatase, subunit ChlI  51.84 
 
 
506 aa  455  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2032  Mg chelatase, subunit ChlI  51.67 
 
 
503 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.175464  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4139  Mg chelatase, subunit ChlI  50.29 
 
 
502 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23660  Mg chelatase-related protein  52.24 
 
 
512 aa  451  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161437  normal  0.0784396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2203  Mg chelatase, subunit ChlI  50.79 
 
 
503 aa  448  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.869212  normal  0.31098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  50.39 
 
 
517 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142573  decreased coverage  0.00119551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5916  Mg chelatase, subunit ChlI  50.69 
 
 
506 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000357839  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2473  Mg chelatase, subunit ChlI  50.78 
 
 
514 aa  433  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0320382  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09840  Mg chelatase-related protein  51.46 
 
 
503 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3122  Mg chelatase, subunit ChlI  51.08 
 
 
506 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00256613  normal  0.153243 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1642  Mg chelatase, subunit ChlI  49.61 
 
 
506 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0110921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2192  Mg chelatase subunit ChlI  48.74 
 
 
510 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81013  normal  0.95004 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1408  Mg chelatase, subunit ChlI  52.44 
 
 
517 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.49996  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  43.11 
 
 
510 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  46.17 
 
 
509 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0677  putative ATP-dependent serine protease  42.94 
 
 
511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147039  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10080  Mg chelatase-related protein  49.22 
 
 
514 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121458  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2096  Mg chelatase, subunit ChlI  49.41 
 
 
502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1220  Mg chelatase, subunit ChlI  43.19 
 
 
516 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3247  Mg chelatase, subunit ChlI  45.98 
 
 
528 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  40.04 
 
 
509 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  44.15 
 
 
509 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  44.03 
 
 
509 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  45.38 
 
 
506 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  45.12 
 
 
510 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  43.59 
 
 
507 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  44.02 
 
 
508 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0638  Mg chelatase-like protein  38.43 
 
 
547 aa  389  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  41.15 
 
 
512 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  46.38 
 
 
514 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  44.14 
 
 
513 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  43.75 
 
 
509 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  45.98 
 
 
504 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  41.29 
 
 
508 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  46.69 
 
 
504 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  41.14 
 
 
512 aa  385  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1445  Mg chelatase-related protein  44.49 
 
 
511 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.555518  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  43.71 
 
 
509 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  43.91 
 
 
509 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  41.26 
 
 
512 aa  379  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  43.25 
 
 
506 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  44.27 
 
 
520 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  39.76 
 
 
512 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4074  Mg chelatase, subunit ChlI  40.95 
 
 
514 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  43.95 
 
 
509 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  43.15 
 
 
506 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  42.8 
 
 
509 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  46.17 
 
 
513 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1391  Mg chelatase-related protein  45.94 
 
 
512 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000825184  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  43.82 
 
 
511 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  46.38 
 
 
501 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  41.36 
 
 
514 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0288  Mg chelatase-related protein  46.05 
 
 
513 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  43.55 
 
 
511 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  42.01 
 
 
509 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  47.07 
 
 
499 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  41.06 
 
 
513 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  45.19 
 
 
498 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  40.08 
 
 
511 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1676  Mg chelatase-like protein  40 
 
 
507 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  43.12 
 
 
509 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  40.77 
 
 
512 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  47.7 
 
 
510 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  37.58 
 
 
509 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1958  Mg chelatase-like protein  40 
 
 
507 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0810185  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2193  Mg chelatase, subunit ChlI  39.1 
 
 
510 aa  365  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000569997  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09250  Mg chelatase-related protein  46.21 
 
 
534 aa  364  2e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0832  Mg chelatase, subunit ChlI  40.32 
 
 
504 aa  363  3e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  47.18 
 
 
496 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  40.59 
 
 
513 aa  363  4e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  43.7 
 
 
505 aa  363  6e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  42.94 
 
 
508 aa  362  1e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  45.1 
 
 
509 aa  361  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  40.2 
 
 
512 aa  360  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  46.53 
 
 
515 aa  360  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  42.38 
 
 
505 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  40.59 
 
 
513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  42.54 
 
 
518 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  41.06 
 
 
512 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  44.59 
 
 
497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  41.99 
 
 
509 aa  356  5e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  43.9 
 
 
507 aa  356  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0512  Mg chelatase, subunit ChlI  42.48 
 
 
516 aa  355  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  45.73 
 
 
485 aa  355  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3288  magnesium chelatase family protein  43.03 
 
 
508 aa  355  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  43.92 
 
 
512 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  40.55 
 
 
506 aa  353  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>