More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0781 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  94.68 
 
 		 814 aa  1513    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  67.01 
 
 		 853 aa  1103    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 812 aa  1652    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  82.39 
 
 		 817 aa  1386    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  94.19 
 
 		 814 aa  1478    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  34.35 
 
 		 747 aa  369  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  33.09 
 
 		 702 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  36.07 
 
 		 771 aa  352  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  34.76 
 
 		 743 aa  349  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.47 
 
 		 837 aa  344  5e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  31.17 
 
 		 837 aa  342  1e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  29.95 
 
 		 834 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  30.85 
 
 		 844 aa  336  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  30.98 
 
 		 849 aa  333  7.000000000000001e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  29.29 
 
 		 863 aa  333  1e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  33.69 
 
 		 744 aa  328  3e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  30.1 
 
 		 843 aa  321  3e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1889  DNA topoisomerase I  34.47 
 
 		 668 aa  319  2e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.806156  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  30.5 
 
 		 827 aa  312  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  30.9 
 
 		 942 aa  306  1.0000000000000001e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  32.07 
 
 		 931 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  29.64 
 
 		 864 aa  298  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  31.7 
 
 		 931 aa  294  4e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  32.39 
 
 		 938 aa  291  4e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  28.41 
 
 		 780 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  32.75 
 
 		 935 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  26.98 
 
 		 855 aa  268  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  28.62 
 
 		 768 aa  266  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  30.96 
 
 		 765 aa  261  3e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  30.82 
 
 		 765 aa  259  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  29.03 
 
 		 704 aa  251  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  29.17 
 
 		 689 aa  251  4e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  29.69 
 
 		 702 aa  251  5e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  28.14 
 
 		 693 aa  248  3e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  28.77 
 
 		 695 aa  246  9e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  26.94 
 
 		 851 aa  243  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  26.94 
 
 		 851 aa  243  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  28.92 
 
 		 865 aa  243  1e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  29.14 
 
 		 759 aa  242  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  29.14 
 
 		 759 aa  242  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  29.17 
 
 		 841 aa  242  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  27.74 
 
 		 793 aa  242  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  30.22 
 
 		 870 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  29.29 
 
 		 700 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  30 
 
 		 869 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  30.3 
 
 		 693 aa  239  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  28.15 
 
 		 853 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  28.56 
 
 		 789 aa  239  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  28.45 
 
 		 694 aa  239  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  30.08 
 
 		 868 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  28.85 
 
 		 700 aa  238  3e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  28.14 
 
 		 743 aa  238  4e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.56 
 
 		 869 aa  237  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  29.36 
 
 		 868 aa  237  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.56 
 
 		 869 aa  237  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.56 
 
 		 869 aa  237  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  29.95 
 
 		 868 aa  237  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  29.16 
 
 		 700 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  30.04 
 
 		 868 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  26.9 
 
 		 836 aa  235  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  25.84 
 
 		 760 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1660  DNA topoisomerase I  27.86 
 
 		 892 aa  234  5e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000915276  normal  0.794129 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  27.45 
 
 		 802 aa  234  5e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2196  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 865 aa  234  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735168  unclonable  0.00000487546 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  30.18 
 
 		 684 aa  234  7.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  29.49 
 
 		 876 aa  233  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  27.65 
 
 		 758 aa  232  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  28.68 
 
 		 865 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  28.68 
 
 		 865 aa  231  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  28.68 
 
 		 865 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  28.68 
 
 		 865 aa  231  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  28.68 
 
 		 865 aa  232  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  28.68 
 
 		 865 aa  231  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  28.68 
 
 		 865 aa  231  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  29.5 
 
 		 869 aa  232  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  28.68 
 
 		 865 aa  231  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1332  DNA topoisomerase I  29.08 
 
 		 876 aa  231  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000656424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1857  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 865 aa  231  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.2475e-18 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  28.32 
 
 		 694 aa  231  5e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  27.5 
 
 		 783 aa  230  8e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  28.84 
 
 		 695 aa  230  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  29.05 
 
 		 879 aa  228  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  27.13 
 
 		 804 aa  228  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1901  DNA topoisomerase I  27.69 
 
 		 896 aa  228  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164413  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  29.66 
 
 		 886 aa  228  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1585  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 894 aa  227  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.328544  normal  0.0409432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  27.81 
 
 		 758 aa  227  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  29.4 
 
 		 702 aa  226  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  26.76 
 
 		 831 aa  226  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  29.59 
 
 		 867 aa  226  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  29.74 
 
 		 898 aa  226  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  28.17 
 
 		 691 aa  226  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  26.64 
 
 		 746 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1660  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 894 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.367793  unclonable  0.0000368554 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  26.17 
 
 		 831 aa  226  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  26.87 
 
 		 780 aa  225  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  26.32 
 
 		 831 aa  225  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  28 
 
 		 669 aa  225  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  27.65 
 
 		 868 aa  224  4e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  27.18 
 
 		 751 aa  224  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>