201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0388 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  254  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  87.4 
 
 
127 aa  224  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  85.83 
 
 
127 aa  221  3e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0517  hypothetical protein  77.17 
 
 
127 aa  197  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0839  hypothetical protein  57.02 
 
 
123 aa  135  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000606152  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  47.22 
 
 
144 aa  110  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  41.58 
 
 
138 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  38 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  34.78 
 
 
332 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  38 
 
 
140 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  44.33 
 
 
131 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  36.36 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  39.13 
 
 
311 aa  87.4  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  38.89 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  39.05 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  41.28 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  35.25 
 
 
321 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  34.29 
 
 
323 aa  85.1  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  35.78 
 
 
385 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  34.29 
 
 
332 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  39.81 
 
 
271 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  35.29 
 
 
131 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  36.7 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  38.32 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  35.71 
 
 
324 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  36.79 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  36.45 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2599  protein of unknown function UPF0066  33.6 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273401  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  34.74 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  36.36 
 
 
160 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  31.07 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  33.93 
 
 
183 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  31.19 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  31.19 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  33.65 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  33.65 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  36.27 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  31.25 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  33.66 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  30.48 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  35.96 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  36.08 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  34.65 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  33.64 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  35.64 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  31.43 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  34.29 
 
 
182 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  36.36 
 
 
144 aa  67  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  31.13 
 
 
205 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  36.7 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  33.98 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  31.48 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  29.81 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  29.46 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  29.91 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  32.76 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  31.3 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  31.07 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  29.13 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3831  protein of unknown function UPF0066  32.71 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  31.43 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  31.67 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  33.9 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  32.38 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  36.36 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  34.23 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  32.04 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  31.43 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  33.96 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  32.99 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  33.07 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  32.99 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  27.78 
 
 
142 aa  62  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  30.77 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  31.3 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  29.63 
 
 
167 aa  62  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  33.61 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  33.02 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  30.63 
 
 
175 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  28.85 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  28.43 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  35.92 
 
 
162 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  35.29 
 
 
164 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  30.77 
 
 
168 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  35.19 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  30.77 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  30.28 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  27.62 
 
 
174 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  35.24 
 
 
157 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  35.05 
 
 
235 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  34.38 
 
 
234 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  32.46 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  35.85 
 
 
154 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  35.24 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  34.29 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  35.24 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  30.77 
 
 
178 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  34.29 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>