202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2681 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  44.56 
 
 
694 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  100 
 
 
692 aa  1397    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  41.52 
 
 
702 aa  510  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  35.6 
 
 
686 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  33.97 
 
 
680 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  32.32 
 
 
672 aa  337  5e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  30.46 
 
 
666 aa  157  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  28.84 
 
 
470 aa  122  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  28.6 
 
 
440 aa  118  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  27.77 
 
 
490 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  29.37 
 
 
456 aa  110  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  28.7 
 
 
485 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  25.43 
 
 
483 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  24.04 
 
 
435 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.32 
 
 
1005 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2881  amidohydrolase  25.18 
 
 
819 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  26.85 
 
 
511 aa  99  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  26.84 
 
 
451 aa  98.2  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  25.88 
 
 
478 aa  95.5  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  24.94 
 
 
407 aa  94.7  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  27.05 
 
 
438 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  29.11 
 
 
1014 aa  92  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  26.41 
 
 
426 aa  91.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  27.11 
 
 
1010 aa  91.3  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  25.17 
 
 
441 aa  90.9  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  24.68 
 
 
543 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  25 
 
 
455 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  21.97 
 
 
484 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  30.05 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  24.89 
 
 
496 aa  84.3  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  24.21 
 
 
432 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  23.95 
 
 
540 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  24.72 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  24.57 
 
 
1111 aa  77.8  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  24.52 
 
 
1059 aa  77.8  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  25.19 
 
 
1138 aa  77.4  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  24.12 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  26.12 
 
 
1042 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  23.06 
 
 
568 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  24.14 
 
 
1084 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  24.77 
 
 
1031 aa  75.5  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  24.77 
 
 
529 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  24.17 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  25.67 
 
 
1042 aa  73.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  25.67 
 
 
1040 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  24.21 
 
 
419 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  24.29 
 
 
438 aa  73.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  27.55 
 
 
480 aa  72.4  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  23.16 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  23.16 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  23.16 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  23.95 
 
 
1113 aa  70.5  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5063  amidohydrolase  29.59 
 
 
381 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304888  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6839  amidohydrolase  23.96 
 
 
437 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00614522  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  24.39 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  22.33 
 
 
1062 aa  68.2  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  24 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  23.15 
 
 
1060 aa  66.6  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  26.09 
 
 
360 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  21.93 
 
 
413 aa  64.7  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  21.12 
 
 
512 aa  64.3  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  23.19 
 
 
407 aa  63.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  23.69 
 
 
421 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  23.79 
 
 
402 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  25.51 
 
 
459 aa  63.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  21.37 
 
 
430 aa  61.6  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  23.8 
 
 
493 aa  61.6  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  26.13 
 
 
391 aa  61.6  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  22.78 
 
 
429 aa  61.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  22.48 
 
 
424 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  23.21 
 
 
414 aa  61.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  22.54 
 
 
390 aa  60.8  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  20.94 
 
 
401 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  30.57 
 
 
413 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  40.82 
 
 
433 aa  60.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  23.28 
 
 
444 aa  59.7  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  24.77 
 
 
425 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  24.8 
 
 
356 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  32.89 
 
 
482 aa  59.7  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  22.84 
 
 
432 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  40.45 
 
 
423 aa  58.9  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  21.89 
 
 
1065 aa  58.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3412  amidohydrolase  32.83 
 
 
405 aa  58.2  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  23.76 
 
 
413 aa  58.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  24.78 
 
 
436 aa  57.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  23.63 
 
 
448 aa  57.4  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  23.32 
 
 
437 aa  57  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  20.94 
 
 
1052 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  23.59 
 
 
430 aa  57  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  22.3 
 
 
412 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  34.85 
 
 
461 aa  57.4  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  30.08 
 
 
426 aa  56.6  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  38.71 
 
 
421 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  22.68 
 
 
426 aa  56.6  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  26.91 
 
 
397 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  39.62 
 
 
431 aa  56.6  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0166  amidohydrolase  34.65 
 
 
418 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  36.54 
 
 
470 aa  56.6  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  23.53 
 
 
415 aa  55.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  25.28 
 
 
406 aa  55.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>