141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1492 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  899    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  54.68 
 
 		 410 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  53.53 
 
 		 412 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  49.49 
 
 		 412 aa  392  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0694  hypothetical protein  50.88 
 
 		 409 aa  393  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.452898  normal  0.129497 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  41.47 
 
 		 437 aa  315  8e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1642  hypothetical protein  34.29 
 
 		 437 aa  220  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 437 aa  217  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  30.95 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  29.95 
 
 		 436 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  30.36 
 
 		 448 aa  173  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  30.51 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  29.59 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  30.54 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  29.06 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  29.16 
 
 		 427 aa  151  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  28.97 
 
 		 435 aa  149  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  29.19 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  29.36 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  29.26 
 
 		 453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  30.95 
 
 		 419 aa  142  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  28.67 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  26.98 
 
 		 432 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3973  hypothetical protein  29.11 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0831495  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1133  hypothetical protein  28.78 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  28.88 
 
 		 423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  28.46 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3309  amine oxidase  24.53 
 
 		 484 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  24.82 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  24.82 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  24.82 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  30.83 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  26.09 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  30.83 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  29.43 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  22.66 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  29.64 
 
 		 484 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  23.76 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  26.03 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  20.36 
 
 		 722 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  24.62 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  26.53 
 
 		 488 aa  57  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  38.37 
 
 		 453 aa  57  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  23.73 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  26.37 
 
 		 486 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  26.64 
 
 		 364 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  27.12 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  22.73 
 
 		 470 aa  55.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  37.21 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  25.81 
 
 		 486 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  23.1 
 
 		 482 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  27.89 
 
 		 520 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  25.82 
 
 		 488 aa  53.5  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  36.05 
 
 		 453 aa  53.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.48 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  37.97 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  20.88 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  25.18 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  24.04 
 
 		 466 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  24.04 
 
 		 466 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  25.34 
 
 		 459 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.77 
 
 		 640 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2919  amine oxidase  26.62 
 
 		 413 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  23.22 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  24.12 
 
 		 463 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2098  amine oxidase  51.22 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  36.05 
 
 		 453 aa  50.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  37.97 
 
 		 453 aa  50.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  21.87 
 
 		 459 aa  50.1  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  20.56 
 
 		 475 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  25.34 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  25.99 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  27.32 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  22.44 
 
 		 492 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  26.7 
 
 		 503 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  31.68 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  25.1 
 
 		 461 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  25.57 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  26.94 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  26.88 
 
 		 591 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  23.86 
 
 		 507 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  38.96 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  37.11 
 
 		 490 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  37.11 
 
 		 490 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  27.93 
 
 		 496 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  22.33 
 
 		 473 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  34.88 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  22.81 
 
 		 520 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  23.01 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  21.54 
 
 		 475 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  26.26 
 
 		 511 aa  47  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6583  FAD dependent oxidoreductase  22.76 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  24 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  34.33 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  52.38 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  52.38 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  23.29 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  23.18 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  22.56 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>