175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0370 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  45.1 
 
 		 179 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  40 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  35.06 
 
 		 183 aa  103  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  38.46 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  36.05 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  33.79 
 
 		 180 aa  87.8  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  36.6 
 
 		 194 aa  87.4  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  34.19 
 
 		 183 aa  84  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  37.34 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  35.76 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  31.97 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  34.15 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  33.33 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  31.87 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  30.61 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  32.43 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  34.51 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  36.77 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  34.01 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  33.11 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  31.29 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  32.62 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  31.21 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  30.5 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  30.63 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  31.68 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  34.01 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  35.53 
 
 		 187 aa  67  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  28.87 
 
 		 178 aa  67  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  35.53 
 
 		 187 aa  67  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  29.68 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  33.57 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  29.25 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  27.89 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  27.22 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  27.74 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  33.78 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  31.54 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  33.54 
 
 		 193 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  31.25 
 
 		 179 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  33.58 
 
 		 199 aa  63.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  33.55 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  33.57 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  31.39 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  32.48 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  28.3 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  32.43 
 
 		 194 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  32.43 
 
 		 194 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  32.43 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  32.41 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  27.59 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2732  hypothetical protein  33.12 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3219  hypothetical protein  33.12 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1770  hypothetical protein  33.12 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3686  2'-5' RNA ligase  33.12 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2784  2'-5' RNA ligase  33.12 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  28.75 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  31.03 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  30.14 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  30.14 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  29.36 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  30.28 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  33.67 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3743  2'-5' RNA ligase  32.47 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  35.58 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  28.66 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  30.84 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  36.46 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  29.63 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  30.28 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  30.5 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  36.46 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  30.88 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  33.1 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3712  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  33.8 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0326  2'-5' RNA ligase  34.86 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  27.52 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  31.85 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  33.68 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  29.36 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  27.21 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  28.97 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  33.68 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  30.6 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  34.31 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  28.29 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  28.08 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2364  hypothetical protein  29.53 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3011  2'-5' RNA ligase  29.45 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  27.4 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  28.31 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  28.67 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>