More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4329 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  99.76 
 
 
419 aa  819    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  100 
 
 
419 aa  821    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  99.76 
 
 
419 aa  819    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  69.71 
 
 
425 aa  555  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3829  major facilitator transporter  63.3 
 
 
429 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0209  major facilitator superfamily MFS_1  66.5 
 
 
429 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  56.64 
 
 
424 aa  443  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1059  major facilitator superfamily MFS_1  57.14 
 
 
420 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  54.59 
 
 
413 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  54.59 
 
 
413 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2943  major facilitator transporter  55.06 
 
 
418 aa  440  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  54.59 
 
 
413 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  54.59 
 
 
413 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  54.59 
 
 
413 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  54.59 
 
 
408 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  54.98 
 
 
413 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  51.53 
 
 
405 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  48.77 
 
 
411 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 
429 aa  302  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  40.81 
 
 
435 aa  293  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4111  major facilitator superfamily MFS_1  39.25 
 
 
431 aa  290  4e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.685239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0758  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 
439 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.801557  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2642  hypothetical protein  41.55 
 
 
425 aa  272  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.428504  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2268  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 
425 aa  272  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000790728 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3259  major facilitator transporter  42.29 
 
 
411 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.363352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0182  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 
405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.742625  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 
437 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 
437 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3238  major facilitator transporter  42.43 
 
 
412 aa  256  7e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3466  major facilitator transporter  42.68 
 
 
419 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0094  major facilitator transporter  40.78 
 
 
419 aa  253  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000571011  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  39.73 
 
 
426 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1171  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 
424 aa  242  7e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2792  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 
366 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  29.97 
 
 
387 aa  126  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0852  major facilitator transporter  27.4 
 
 
615 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44665  predicted protein  35.08 
 
 
522 aa  113  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32694  MFS family transporter  31.82 
 
 
544 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.830885  normal  0.0798771 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.3 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0200  major facilitator transporter  26.06 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 
406 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.5 
 
 
440 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  25.32 
 
 
685 aa  63.5  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 
401 aa  63.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  26.33 
 
 
434 aa  63.2  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  30.3 
 
 
462 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 
408 aa  60.5  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  23.96 
 
 
407 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 
419 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 
419 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.39 
 
 
409 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  26.25 
 
 
405 aa  58.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
413 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  26.27 
 
 
425 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 
406 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  23.88 
 
 
411 aa  57.8  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  30.43 
 
 
429 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 
427 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  21.56 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
516 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  21.53 
 
 
453 aa  55.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  27.74 
 
 
404 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  23.92 
 
 
395 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0673  major facilitator transporter  27.22 
 
 
401 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.317813 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  22.28 
 
 
411 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  28.46 
 
 
428 aa  54.3  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1237  major facilitator transporter  25.6 
 
 
413 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  20.67 
 
 
399 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2630  fosmidomycin resistance protein  24.86 
 
 
420 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 
395 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  28.19 
 
 
539 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5127  major facilitator transporter  31.08 
 
 
447 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  26.24 
 
 
438 aa  53.1  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  21.11 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2691  major facilitator family transporter  30.71 
 
 
454 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0232907  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 
510 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  21.11 
 
 
399 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  21.11 
 
 
399 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  21.11 
 
 
399 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
462 aa  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  21.11 
 
 
399 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  21.11 
 
 
399 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  30.89 
 
 
461 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  22.93 
 
 
395 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  22.98 
 
 
400 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  21.11 
 
 
399 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  21.7 
 
 
396 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 
415 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4107  major facilitator transporter  25.95 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.7 
 
 
424 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4594  major facilitator transporter  30.41 
 
 
447 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.319083  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  29.91 
 
 
401 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.55 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 
387 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.47 
 
 
478 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>