72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1520 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1520  putative ABC transporter  100 
 
 
576 aa  1125    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703438  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1549  putative ABC transporter  98.6 
 
 
586 aa  1097    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1572  putative ABC transporter  98.6 
 
 
586 aa  1097    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8871  putative ABC transporter  54.26 
 
 
629 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872872  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0079  putative ABC transporter  52.87 
 
 
565 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.459634  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08870  hypothetical protein  49.55 
 
 
566 aa  468  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0706838  normal  0.0205572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3266  putative ABC transporter  51.68 
 
 
571 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.025779  normal  0.223838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2523  putative ABC transporter  49.25 
 
 
571 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2260  putative ABC transporter  48.26 
 
 
571 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000139745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2641  putative ABC transporter  50.81 
 
 
669 aa  438  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374728  normal  0.779452 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1353  putative ABC transporter  47.63 
 
 
667 aa  418  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00435841  hitchhiker  0.000139423 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08690  hypothetical protein  46.78 
 
 
602 aa  402  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24700  hypothetical protein  47.96 
 
 
784 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.303383  normal  0.0806263 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0932  hypothetical protein  42.09 
 
 
650 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  41.53 
 
 
569 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1090  hypothetical protein  46.49 
 
 
737 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24320  hypothetical protein  45.44 
 
 
584 aa  372  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1366  putative ABC transporter  44.38 
 
 
572 aa  362  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7362  hypothetical protein  40.11 
 
 
564 aa  341  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0821059  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  39.31 
 
 
687 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2220  putative ABC transporter  37.48 
 
 
619 aa  309  9e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3430  putative ABC transporter  38.11 
 
 
631 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.790282  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  43.02 
 
 
566 aa  232  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1086  hypothetical protein  35.47 
 
 
551 aa  221  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00952601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24740  hypothetical protein  39.94 
 
 
551 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.043803  normal  0.105516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0928  hypothetical protein  39.87 
 
 
540 aa  204  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2645  putative transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 
526 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1736  putative ABC transporter  32.96 
 
 
556 aa  168  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1394  hypothetical protein  37.5 
 
 
543 aa  80.5  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3265  putative ABC transporter  34.05 
 
 
532 aa  74.7  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1735  putative ABC transporter  31.53 
 
 
552 aa  72.4  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43735  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6775  putative ABC transporter  29.49 
 
 
589 aa  70.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122043  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08880  predicted GTPase  34.29 
 
 
564 aa  69.7  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.141009  normal  0.0562111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24310  hypothetical protein  39.06 
 
 
568 aa  67.4  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  37.98 
 
 
542 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0428896  hitchhiker  0.0000949376 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3738  hypothetical protein  33.33 
 
 
618 aa  64.7  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2522  putative ABC transporter  31.11 
 
 
539 aa  63.5  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.504723  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24690  GTPase of unknown function  37.31 
 
 
539 aa  63.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6041  normal  0.0378138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0080  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.63 
 
 
532 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.170633  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2259  GTP-binding protein HSR1-related  32.95 
 
 
537 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000117964 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.61 
 
 
548 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0933  hypothetical protein  32.77 
 
 
578 aa  62.4  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2219  GTPase  34.35 
 
 
673 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1571  putative ABC transporter  25.91 
 
 
525 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1548  putative ABC transporter  25.91 
 
 
525 aa  61.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1519  putative ABC transporter  25.91 
 
 
525 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1326  hypothetical protein  28.95 
 
 
568 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24730  predicted GTPase  35.88 
 
 
517 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0664672  normal  0.0671171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2640  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.62 
 
 
550 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133942  normal  0.721182 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1087  putative ABC transporter  30.61 
 
 
523 aa  59.3  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0151577  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1091  putative ABC transporter  31.1 
 
 
585 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.631509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7361  putative ABC transporter  31.19 
 
 
547 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.901699  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  28.48 
 
 
583 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3997  hypothetical protein  26.27 
 
 
642 aa  58.9  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  21.38 
 
 
589 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  30.52 
 
 
564 aa  57.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3429  hypothetical protein  38.46 
 
 
802 aa  58.2  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.224896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2559  putative ABC transporter  29.91 
 
 
542 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  30 
 
 
587 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1350  putative ABC transporter  31.52 
 
 
524 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.43815  hitchhiker  0.000106139 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08700  hypothetical protein  31.31 
 
 
586 aa  55.5  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1367  putative ABC transporter  29 
 
 
555 aa  55.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621246  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  23.74 
 
 
546 aa  54.3  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2644  ATP-binding membrane protein  31.41 
 
 
453 aa  53.9  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.908609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8870  putative ABC transporter  28.85 
 
 
590 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0939636  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  23.73 
 
 
585 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  28.05 
 
 
1164 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0929  hypothetical protein  32.87 
 
 
518 aa  50.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  28.1 
 
 
585 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  24.29 
 
 
585 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5212  small GTP-binding protein  26.63 
 
 
489 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000545834 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1234  GTP-binding protein EngA  25.45 
 
 
444 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>