More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0916 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0916  replication factor C large subunit  100 
 
 		 483 aa  996    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.371942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1074  replication factor C large subunit  51.75 
 
 		 481 aa  478  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0831  replication factor C large subunit  53.77 
 
 		 454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.248634  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1751  replication factor C large subunit  50.97 
 
 		 451 aa  443  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0498  replication factor C large subunit  47.45 
 
 		 476 aa  433  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3011  replication factor C large subunit  40.14 
 
 		 507 aa  326  6e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.379588  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2242  replication factor C large subunit  37.3 
 
 		 497 aa  324  2e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0470  replication factor C large subunit  39.52 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2075  replication factor C large subunit  42.89 
 
 		 642 aa  319  6e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.314797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1757  replication factor C large subunit  38.07 
 
 		 497 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0412755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0729  AAA ATPase central domain protein  37.11 
 
 		 514 aa  298  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1913  AAA ATPase central domain protein  39.19 
 
 		 497 aa  291  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1810  replication factor C large subunit  35.11 
 
 		 500 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0629  replication factor C large subunit  32.3 
 
 		 484 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1361  replication factor C large subunit  35.02 
 
 		 474 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1333  replication factor C large subunit  32.48 
 
 		 492 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.513611  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0507  AAA ATPase central domain protein  36.46 
 
 		 437 aa  229  6e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1324  replication factor C large subunit  33.25 
 
 		 482 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.414275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1352  replication factor C large subunit  33.98 
 
 		 484 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0266  replication factor C large subunit  32.15 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0657  replication factor C large subunit  31.65 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  hitchhiker  0.00784495 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0920  replication factor C large subunit  30.85 
 
 		 418 aa  172  9e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0003  replication factor C large subunit  29.12 
 
 		 422 aa  172  9e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2009  replication factor C large subunit  30.84 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0004  replication factor C large subunit  29.95 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2049  replication factor C large subunit  28.78 
 
 		 443 aa  160  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1828  AAA ATPase central domain protein  32.31 
 
 		 405 aa  146  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0627242  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  27.62 
 
 		 385 aa  140  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0267  replication factor C small subunit  38.6 
 
 		 325 aa  124  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1668  replication factor C small subunit  35.78 
 
 		 320 aa  120  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.348586  normal  0.014006 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0583  replication factor C small subunit  35 
 
 		 324 aa  116  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0695  replication factor C small subunit  35.78 
 
 		 319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1846  replication factor C small subunit  35.32 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.432596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1248  replication factor C small subunit  31.14 
 
 		 322 aa  113  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1424  replication factor C small subunit  33.33 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0411425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30204  predicted protein  27.49 
 
 		 498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.381291  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0005  replication factor C small subunit  35.92 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1210  replication factor C small subunit  33.33 
 
 		 315 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0002  replication factor C small subunit  34.4 
 
 		 329 aa  109  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0484  replication factor C small subunit  33.33 
 
 		 315 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2008  replication factor C small subunit  35.92 
 
 		 328 aa  109  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0656  replication factor C small subunit  34.1 
 
 		 329 aa  109  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0195839  hitchhiker  0.005923 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0919  replication factor C  34.16 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2050  replication factor C small subunit  34.43 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06303  Replication factor C like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78622]  29.67 
 
 		 1092 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0750  ATPase central domain-containing protein  31.25 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0240  replication factor C  31.28 
 
 		 316 aa  103  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1412  replication factor C small subunit  30.22 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119614  replication factor C subunit 5 (36kDa), probable  29.39 
 
 		 332 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00630  DNA replication factor, putative  30.59 
 
 		 373 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.853584  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00420  sister chromatid cohesion-related protein, putative  26.22 
 
 		 892 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0188  Replication factor C  33.64 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00219478  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11922  predicted protein  30.49 
 
 		 338 aa  100  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60537  DNA replication factor C  31.78 
 
 		 322 aa  100  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0632786  normal  0.140839 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1827  Replication factor C  33.33 
 
 		 330 aa  99.8  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01320  purine nucleotide binding protein, putative  25.83 
 
 		 1001 aa  99.8  9e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0515  replication factor C small subunit  31.22 
 
 		 321 aa  99  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.647591  normal  0.738478 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9547  predicted protein  35.21 
 
 		 350 aa  98.2  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.606232  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02470  Activator 1 40 kDa subunit, putative  31.82 
 
 		 347 aa  98.2  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39197  predicted protein  32.74 
 
 		 334 aa  97.8  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.023839  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0994  replication factor C small subunit  29.41 
 
 		 323 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.265102  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1582  replication factor C small subunit  31.25 
 
 		 334 aa  94  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08064  subunit of heteropentameric Replication factor (Eurofung)  31.65 
 
 		 398 aa  93.2  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06517  subunit of heteropentameric replication factor (Eurofung)  29.09 
 
 		 289 aa  93.2  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1927  replication factor C small subunit  29.03 
 
 		 326 aa  92.8  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1674  replication factor C small subunit  27.43 
 
 		 322 aa  92.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35082  predicted protein  31.92 
 
 		 342 aa  92.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.216032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72583  Replication factor C, subunit RFC4  29.82 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0238341 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0027  Replication factor C  29.95 
 
 		 330 aa  91.3  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1910  Replication factor C  29.49 
 
 		 341 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1126  replication factor C small subunit  28.57 
 
 		 322 aa  88.6  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.609813  normal  0.991344 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2103  replication factor C small subunit  27.08 
 
 		 326 aa  88.2  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39313  DNA replication factor C  28.77 
 
 		 325 aa  87.8  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35815  predicted protein  23.6 
 
 		 764 aa  86.7  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.756935 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49374  predicted protein  32.04 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.186193  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43994  predicted protein  28.26 
 
 		 942 aa  85.1  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02969  subunit of heteropentameric Replication factor C (RF-C) (Eurofung)  30 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0384  replication factor C small subunit  29.68 
 
 		 327 aa  83.2  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.817409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00770  activator 1 41 kda subunit, putative  29.77 
 
 		 363 aa  82  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1312  replication factor C small subunit  34.43 
 
 		 940 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.425984  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0262  replication factor C small subunit  29.15 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0941959  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  26.57 
 
 		 579 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45690  predicted protein  31.22 
 
 		 1015 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.136558  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  26.02 
 
 		 569 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.81 
 
 		 579 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  24.63 
 
 		 582 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.64 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  23.97 
 
 		 649 aa  63.9  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2501  recombination factor protein RarA  28.32 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.30319 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41967  predicted protein  24.78 
 
 		 235 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.296814  normal  0.0690197 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.21 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18481  DNA polymerase, gamma and tau subunits  25.47 
 
 		 595 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.203757  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0824  recombination factor protein RarA  25.74 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00630594  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0850  replication factor C small subunit 2  27.94 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  24.22 
 
 		 572 aa  61.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48947  predicted protein  23.55 
 
 		 725 aa  60.8  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00599657 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0942  DNA-directed DNA polymerase  20.92 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1776  recombination factor protein RarA  22.9 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1988  replication factor C small subunit 2  23.51 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>