More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0637 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2660  TrkA domain-containing protein  43.81 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0646767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  46.67 
 
 		 214 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  39.53 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  40 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  34.45 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1323  TrkA-like  32.86 
 
 		 264 aa  128  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2285  TrkA-N domain-containing protein  34.12 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1641  TrkA domain-containing protein  35.32 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0270311  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4527  TrkA-N domain-containing protein  32.57 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.621759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12706  trk system potassium uptake protein ceoB  33 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1486  TrkA domain-containing protein  34.3 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.370955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1634  TrkA-N domain protein  33.65 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000521907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1877  TrkA-N domain protein  31.84 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.608746  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2903  TrkA domain-containing protein  30.54 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1642  TrkA-N domain protein  33.81 
 
 		 219 aa  118  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623208  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1521  TrkA-N domain protein  33.5 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.709024  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2874  TrkA-N domain protein  33.83 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1451  TrkA domain-containing protein  33.82 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0437642  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6759  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  32.23 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0519804 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0807  TrkA-N domain protein  42.98 
 
 		 137 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1398  TrkA domain-containing protein  32.51 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.870164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3927  TrkA domain-containing protein  31.5 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0233751  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2473  TrkA domain-containing protein  31.5 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.214066  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1562  TrkA-N domain protein  32.02 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1923  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 		 220 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2197  TrkA-N  33.85 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2243  TrkA domain-containing protein  33.85 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.20721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2186  TrkA domain-containing protein  33.85 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0106506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5191  TrkA domain-containing protein  34.33 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0357985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  31.13 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1917  TrkA-N domain protein  32.31 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.678679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0253  TrkA-N domain protein  39.06 
 
 		 138 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1708  TrkA-N domain protein  30.93 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0311888  normal  0.0547174 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2083  TrkA-N domain protein  30.54 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1347  TrkA-N  39.68 
 
 		 134 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0274494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01270  K+ transport system, NAD-binding component  30.7 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16170  K+ transport system, NAD-binding component  30.1 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.11506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3756  TrkA-N domain protein  30.69 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000258956  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1713  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1942  TrkA-N domain protein  31.9 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0161521 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0026  TrkA domain-containing protein  39.67 
 
 		 134 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_26  cation transport protein, Trk system  39.67 
 
 		 134 aa  102  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0437885  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0027  potassium uptake protein, putative  37.5 
 
 		 134 aa  101  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248151  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1928  putative potassium transporter  30.8 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292607  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00280  K+ transport system, NAD-binding component  32.2 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  27.88 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1405  TrkA-N domain protein  30.96 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.364271  normal  0.729476 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0250  TrkA-N domain protein  30.14 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1656  TrkA domain-containing protein  38.06 
 
 		 143 aa  93.6  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153236  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  29.44 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1729  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 		 143 aa  91.3  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000411585  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  29.5 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  27.01 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  29.5 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  27.7 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  28.11 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  28.05 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  24.77 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.23 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  29.95 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  29.17 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  27.36 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  28.64 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  28.97 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  29.15 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  25.57 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  27.64 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  29.44 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  27.78 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  25.12 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  28.97 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  27.64 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  24.31 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  27.88 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  27.7 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2079  TrkA-N domain protein  26.54 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  26.26 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  28.5 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  23.15 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  30.51 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  28.44 
 
 		 630 aa  77  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  27.4 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  27.56 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  25.11 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  31.36 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1262  TrkA domain-containing protein  26.92 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  27.49 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  25.6 
 
 		 449 aa  75.9  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  28.82 
 
 		 457 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1399  TrkA-N domain protein  28.96 
 
 		 455 aa  75.5  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000200171  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1685  TrkA domain-containing protein  28.97 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.124287  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  27.72 
 
 		 626 aa  74.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  24.23 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  26.67 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  27.03 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  25.79 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  21.3 
 
 		 620 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>