More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4816 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  91.18 
 
 		 222 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  82.91 
 
 		 224 aa  322  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  82.91 
 
 		 224 aa  322  4e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  82.91 
 
 		 224 aa  322  4e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5663  transcriptional regulator, TetR family  53.28 
 
 		 214 aa  211  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1730  regulatory protein, TetR  50.76 
 
 		 201 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1578  regulatory protein TetR  41.74 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0564  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0896844  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4450  regulatory protein, TetR  37.44 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4908  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 210 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0359  transcriptional regulator, TetR family  39.41 
 
 		 233 aa  125  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3068  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 207 aa  122  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0906512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1708  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.62 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000453712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4737  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0397829  hitchhiker  0.000000987598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4652  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104872  hitchhiker  0.00491998 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.2 
 
 		 232 aa  119  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4859  TetR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 211 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203125  hitchhiker  0.0000563821 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.63 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4916  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715752  hitchhiker  0.000000000695443 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1912  TetR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5613  hypothetical protein  38.24 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64640  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0230  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.4 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220471  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0892  hypothetical protein  34.86 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0124  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.4 
 
 		 205 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000427607  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0667  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764927  normal  0.0361684 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1526  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.97703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00264  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.68 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002153  unsaturated fatty acid biosythesis repressor FabR  35.68 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000110455  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.18 
 
 		 213 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.9 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0175  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.9 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4180  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.9 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0026827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0179  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.9 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00396424  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4076  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.36 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4078  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.9 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0177  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.9 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0234685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0172  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.9 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.291893  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0120  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.36 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102544  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0139  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.36 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0390891  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0137  DNA-binding transcriptional repressor FabR  45.86 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0178  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.9 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155373  normal  0.944765 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3541  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.9 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4711  DNA-binding transcriptional repressor FabR  45.86 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4773  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.82 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00222933  hitchhiker  0.00284138 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0192  DNA-binding transcriptional repressor FabR  45.86 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0188643  normal  0.031406 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03848  DNA-binding transcriptional repressor  35.58 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.58 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.02 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.58 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0163  DNA-binding transcriptional repressor FabR  45.11 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.58 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.36 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  35.58 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4449  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.02 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.563556  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  37.02 
 
 		 215 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  34.5 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0129  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.32 
 
 		 218 aa  98.6  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.555645  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4339  DNA-binding transcriptional repressor FabR  43.94 
 
 		 205 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000022912  hitchhiker  0.00000127177 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  38.07 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  41.79 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1493  DNA-binding transcriptional repressor FabR  36.18 
 
 		 202 aa  95.9  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.132494  normal  0.0684627 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  42.54 
 
 		 212 aa  95.1  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2287  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.101004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03880  transcriptional regulator TetR family  31.9 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568548  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2300  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1957  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0421083  normal  0.138407 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  31.62 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1272  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3792  hypothetical protein  28.41 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44540  hypothetical protein  27.05 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.389288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2619  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0254896  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>