More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0854 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0854  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 225 aa  443  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  91.36 
 
 		 221 aa  401  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5763  short chain dehydrogenase  78.73 
 
 		 222 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5387  short chain dehydrogenase  78.73 
 
 		 222 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5476  short chain dehydrogenase  78.73 
 
 		 222 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0679291  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.99 
 
 		 226 aa  244  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.71 
 
 		 225 aa  235  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.15 
 
 		 227 aa  215  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  51.82 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39280  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1778  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  54.02 
 
 		 228 aa  201  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0974  short chain dehydrogenase  49.33 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0177058  normal  0.671199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91873  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25540  short-chain alcohol dehydrogenase  44 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1729  short chain dehydrogenase  42.6 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.61 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3934  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.63 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 293 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  0.058004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.61 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.31881  normal  0.311726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 		 282 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  34.78 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.62 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.255746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.19 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.6 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 		 240 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4049  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.12 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  33.61 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  32.19 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  32.19 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  33.89 
 
 		 1270 aa  102  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0733  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.39 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 		 295 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 		 247 aa  98.6  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 270 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 252 aa  97.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.89 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000671935 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.27 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  32.08 
 
 		 252 aa  97.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  39.89 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 244 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  31.17 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  31.62 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 		 264 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  37.16 
 
 		 270 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0571  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.14 
 
 		 245 aa  95.9  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.653945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 270 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 		 277 aa  95.9  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  30.54 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06330  oxidoreductase  30.17 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.646831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 		 238 aa  95.1  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 		 276 aa  95.1  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.7 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2400  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 286 aa  94.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.196422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  41.9 
 
 		 277 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0691773  normal  0.0221679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 		 272 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  31.13 
 
 		 295 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 269 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 279 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 281 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6766  putative short-chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 279 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 		 262 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.64 
 
 		 254 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 		 248 aa  92.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_004310  BR0458  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.59 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 		 254 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.59 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.82564  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 278 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 280 aa  92  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 273 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0876  short chain dehydrogenase  33 
 
 		 274 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>