234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1717 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2036  NMT1/THI5 like domain protein  98.14 
 
 		 322 aa  640    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.756885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1717  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  652    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1097  NMT1/THI5 like domain protein  98 
 
 		 322 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0236053  normal  0.472572 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0706  putative secreted protein  43.67 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0893  NMT1/THI5-like domain-containing protein  43.19 
 
 		 346 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  0.0747701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1262  NMT1/THI5-like domain-containing protein  42.72 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0834  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  42.64 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.576945  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0799  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  42.42 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1089  NMT1/THI5-like domain-containing protein  42 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7482  ABC transporter periplasmic-binding protein  38.87 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061073  normal  0.0687655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  40.72 
 
 		 339 aa  242  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0425  perplasmic binding protein of ABC transporter  41.99 
 
 		 341 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1162  NMT1/THI5 like domain protein  41.07 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.139454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0471  NMT1/THI5 like domain protein  39.02 
 
 		 380 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0570  perplasmic binding protein of ABC transporter  39.74 
 
 		 374 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.288854  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0331  perplasmic binding protein of ABC transporter  40.68 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.18125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0570  ABC transporter periplasmic-binding protein  40.69 
 
 		 339 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0260  perplasmic binding protein of ABC transporter  39.26 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3687  ABC transporter substrate-binding protein  41.5 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  39.13 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3143  perplasmic binding protein of ABC transporter  38.74 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786011  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  38.54 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  39.2 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5136  NMT1/THI5 like domain protein  37.95 
 
 		 342 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1471  permease protein of ABC transporter  37.46 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1265  ABC transporter periplasmic-binding protein  39.55 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.147763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2012  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.87 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1384  permease protein of ABC transporter  37.3 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.178302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1093  NMT1/THI5 like domain protein  39.47 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000718314  normal  0.110975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2040  NMT1/THI5 like domain protein  39.05 
 
 		 328 aa  205  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3874  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.27 
 
 		 336 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1721  NMT1/THI5-like domain-containing protein  38.74 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.768998  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2591  NMT1/THI5-like domain-containing protein  37.19 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.329095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3213  ABC transporter, periplasmic binding component-related protein  37.09 
 
 		 342 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.357764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3563  NMT1/THI5-like domain-containing protein  34.85 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.087558  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  27 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2034  NMT1/THI5 like domain protein  33.94 
 
 		 347 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599976  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2950  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.71 
 
 		 1004 aa  99  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  29.41 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 		 1004 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1173  NMT1/THI5 like domain protein  27.61 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0956705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  27.22 
 
 		 674 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3508  twin-arginine translocation pathway signal  25.87 
 
 		 342 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.276709  normal  0.0987839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  28.74 
 
 		 336 aa  89.7  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 		 915 aa  89.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5087  NMT1/THI5-like domain-containing protein  26.13 
 
 		 342 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2932  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.3 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.01782  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  26.24 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0036  histidine kinase  24.37 
 
 		 856 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0619  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  27.2 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5201  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.92 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.27 
 
 		 1238 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3667  hypothetical protein  28.74 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1583  NMT1/THI5 like domain protein  29.67 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1730  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.96 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.524252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2049  NMT1/THI5 like domain protein  29.6 
 
 		 334 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.77 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4359  twin-arginine translocation pathway signal  26.43 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2733  NMT1/THI5 like domain protein  26.52 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.546218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0343  NMT1/THI5-like domain-containing protein  33.86 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.010021  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  27.5 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.87 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1084  NMT1/THI5 like domain protein  29.33 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00229881  normal  0.0195344 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3755  twin-arginine translocation pathway signal  27.21 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  26.67 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  26.36 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  27.61 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3117  NMT1/THI5 like domain protein  24.62 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1075  NMT1/THI5 like domain-containing protein  26.55 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.469481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  26.82 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2373  NMT1/THI5-like domain-containing protein  29.72 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.163906 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  23.84 
 
 		 721 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0306  twin-arginine translocation pathway signal  26.48 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3204  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.76 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0443411  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1937  diguanylate cyclase  25.31 
 
 		 775 aa  73.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  27.27 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0815  NMT1/THI5 like domain protein  26.23 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.6 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0622  NMT1/THI5 like domain protein  26.17 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  26.17 
 
 		 593 aa  72.8  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1358  NMT1/THI5 like domain protein  26.18 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502461  normal  0.023119 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  24.37 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0451  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.05 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0436  NMT1/THI5 like protein  23.05 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  24.18 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4165  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.74 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0994431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3936  NMT1/THI5 like domain protein  29.39 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3298  NMT1/THI5 like domain protein  26.12 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5403  hypothetical protein  24.71 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164568  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  21.79 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  24.06 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2701  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.75 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  24.79 
 
 		 1065 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2795  NMT1/THI5 like domain protein  25.59 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  24.31 
 
 		 794 aa  69.3  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30906  predicted protein  23.74 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.407472  normal  0.0307188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.74 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3647  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  25.44 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  25.56 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>