197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0489 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  55.51 
 
 		 272 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  52.21 
 
 		 272 aa  270  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0430  UspA domain-containing protein  52.21 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3500  UspA domain-containing protein  50.36 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3807  UspA domain protein  50.36 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3883  UspA domain protein  49.64 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29253  normal  0.0935727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2621  UspA domain-containing protein  51.84 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  49.09 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  43.38 
 
 		 271 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  43.59 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  44.57 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  44.93 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  42.96 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  42.55 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  43.01 
 
 		 271 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  45.22 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4049  hypothetical protein  40.93 
 
 		 274 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.36673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  43.07 
 
 		 271 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  41.2 
 
 		 270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4723  UspA domain protein  37.99 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.973873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  42.39 
 
 		 271 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  41.22 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  42.2 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  41.58 
 
 		 270 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1367  hypothetical protein  39.01 
 
 		 276 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1913  hypothetical protein  36.69 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.082206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  38.35 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3434  hypothetical protein  37.55 
 
 		 275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 277 aa  171  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1346  hypothetical protein  36.3 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.658073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1935  hypothetical protein  37.18 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.774934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  38.6 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  39.37 
 
 		 278 aa  161  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2790  hypothetical protein  39.64 
 
 		 277 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.153836 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  36.08 
 
 		 279 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  36.08 
 
 		 279 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  36.14 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  40.57 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1143  hypothetical protein  32.74 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3504  UspA domain-containing protein  36.9 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0778665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  30.74 
 
 		 281 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  35.13 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  31.75 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  33.1 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  32.75 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  29.89 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  38.04 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  31.82 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  33.45 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  36.51 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  38.15 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4438  hypothetical protein  34.04 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3811  UspA domain protein  36.9 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.860312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  40 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  36.65 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  32.28 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 286 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1765  UspA domain-containing protein  32.97 
 
 		 315 aa  99  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  31.14 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  39.57 
 
 		 280 aa  99  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  31.12 
 
 		 278 aa  99  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  30.9 
 
 		 277 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  32.14 
 
 		 274 aa  98.6  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  28.98 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  31.44 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  30.53 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  29.33 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2101  UspA domain protein  32.43 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  0.400879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  30.45 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  30.25 
 
 		 276 aa  95.9  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  33.68 
 
 		 278 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  33.68 
 
 		 278 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  33.68 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  33.68 
 
 		 279 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  37.7 
 
 		 242 aa  95.9  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 287 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0571  hypothetical protein  36.88 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  32.42 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  35.23 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7291  putative universal stress protein UspA  32.13 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.103507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0429  UspA domain-containing protein  35.26 
 
 		 295 aa  92  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  37.02 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2574  hypothetical protein  29.6 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  31.74 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0409  UspA domain-containing protein  41.26 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  31.87 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  38.55 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0398  UspA domain-containing protein  37.3 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  39.66 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  37.14 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  38.55 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>