106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2282 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  100 
 
 
787 aa  1568    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  48.79 
 
 
787 aa  732    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  41.93 
 
 
787 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  45.24 
 
 
787 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  41.42 
 
 
787 aa  608  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  39.36 
 
 
788 aa  601  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  39.34 
 
 
787 aa  592  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  41.3 
 
 
787 aa  591  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  41.44 
 
 
793 aa  581  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  40.41 
 
 
786 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  39.62 
 
 
789 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  40.28 
 
 
787 aa  558  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  41.12 
 
 
789 aa  555  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  39.31 
 
 
791 aa  553  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  39.26 
 
 
789 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  39.48 
 
 
788 aa  553  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  39.26 
 
 
789 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  38.96 
 
 
787 aa  545  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  37.63 
 
 
787 aa  532  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  40.53 
 
 
787 aa  518  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  38.31 
 
 
787 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  39.09 
 
 
788 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  39.04 
 
 
790 aa  514  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  36.68 
 
 
787 aa  510  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  38.75 
 
 
789 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  37.74 
 
 
787 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  38.08 
 
 
788 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  39.46 
 
 
793 aa  498  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 
786 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  38.89 
 
 
786 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  37.23 
 
 
800 aa  488  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  38.12 
 
 
786 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  37.55 
 
 
793 aa  478  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  38.99 
 
 
786 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  38.05 
 
 
788 aa  466  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  37.63 
 
 
789 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  38.39 
 
 
790 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  31.87 
 
 
792 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  29.12 
 
 
791 aa  310  8e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  29.54 
 
 
792 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 
792 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  28.36 
 
 
787 aa  253  9.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  25.76 
 
 
797 aa  243  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  24.17 
 
 
1132 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  24.96 
 
 
947 aa  146  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  23.26 
 
 
1132 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  22.73 
 
 
774 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  21.43 
 
 
773 aa  127  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  24.72 
 
 
859 aa  125  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  22.7 
 
 
1090 aa  122  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  23.25 
 
 
737 aa  118  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  22.67 
 
 
868 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  23.43 
 
 
1177 aa  95.1  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  23.23 
 
 
1232 aa  94.7  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  20.85 
 
 
1016 aa  90.9  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  23.36 
 
 
1110 aa  90.9  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 
1143 aa  86.3  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  21.49 
 
 
876 aa  84.3  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  20.61 
 
 
917 aa  75.5  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  17.48 
 
 
1068 aa  71.6  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  19.74 
 
 
743 aa  68.9  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01820  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.08 
 
 
811 aa  61.6  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 
859 aa  57.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2228  ABC transporter, permease  24.89 
 
 
779 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.622849  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  29.09 
 
 
759 aa  56.2  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  23.39 
 
 
848 aa  56.2  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  23.47 
 
 
858 aa  53.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2512  ABC transporter, permease protein  23.15 
 
 
775 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00525405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0969  hypothetical protein  25.65 
 
 
806 aa  52.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.208929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  29.66 
 
 
411 aa  52  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2306  ABC transporter permease  28.95 
 
 
779 aa  52  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2274  ABC transporter, permease  28.95 
 
 
779 aa  52  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000117587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2481  ABC transporter permease  28.95 
 
 
779 aa  52  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00745912  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  26.28 
 
 
416 aa  51.6  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2502  ABC transporter, permease protein  28.95 
 
 
735 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  25.08 
 
 
836 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  24.24 
 
 
838 aa  51.2  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2577  ABC transporter, permease protein  22.78 
 
 
779 aa  51.2  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000406057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  23.99 
 
 
849 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  25.4 
 
 
414 aa  49.7  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  19.37 
 
 
749 aa  49.7  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  26.4 
 
 
393 aa  48.9  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  22.6 
 
 
873 aa  48.5  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  25.95 
 
 
930 aa  48.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1572  ABC transporter, permease  22.31 
 
 
405 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00402772  normal  0.231871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 
855 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  24.29 
 
 
416 aa  45.8  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  24.25 
 
 
1211 aa  45.8  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 
384 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 
391 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 
383 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  26.75 
 
 
845 aa  45.8  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 
391 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  25 
 
 
391 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  25 
 
 
391 aa  45.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  25 
 
 
391 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  25 
 
 
391 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  25.69 
 
 
897 aa  45.4  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 
383 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  33.72 
 
 
419 aa  44.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>