236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0772 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 307 aa  601  1.0000000000000001e-171  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  47.06 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  38.1 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  34.96 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  34.96 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  25.75 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  24.32 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4602  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  25.24 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0681  hypothetical protein  32.1 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000427065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  25.5 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  24.18 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  26.65 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  24.18 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  23.71 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  24.25 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1115  hypothetical protein  25 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 351 aa  69.3  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4253  hypothetical protein  22.34 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  31.06 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1289  hypothetical protein  25.08 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  32.33 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0651  hypothetical protein  36.59 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14860  hypothetical protein  39.13 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1310  hypothetical protein  39.13 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  32.35 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  28.89 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  22.67 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  30.83 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  30.83 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  30.83 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  30.83 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1056  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0545151  normal  0.0954786 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  30.83 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  29.55 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  29.55 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  33.06 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3610  cytoskeletal protein RodZ  26.16 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.261218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  24.24 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  34.96 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  24.31 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2366  hypothetical protein  24.68 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000180475  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  24.23 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1433  hypothetical protein  40.54 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0955  hypothetical protein  32.17 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1903  hypothetical protein  39.71 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  23.33 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1745  hypothetical protein  24.92 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.934061 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  44.12 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  32.06 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3501  helix-turn-helix domain-containing protein  40.79 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02982  hypothetical protein  22.46 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0033569  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  31.3 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  31.3 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1543  hypothetical protein  23.49 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0277008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3010  cytoskeletal protein RodZ  24.6 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  40.74 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1789  XRE family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 196 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1247  hypothetical protein  39.19 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  38.37 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2936  helix-turn-helix domain-containing protein  39.44 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000364599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  40.91 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1117  cytoskeletal protein RodZ  24.58 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4326  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137482  hitchhiker  0.0000000466309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2738  cytoskeletal protein RodZ  25.84 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  28 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  33.33 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0419  cytoskeletal protein RodZ  22.33 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250443 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2986  hypothetical protein  24.16 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  24.79 
 
 		 368 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 287 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  43.66 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  42.68 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1304  hypothetical protein  23.69 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.358392  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  35.9 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0403  hypothetical protein  24.18 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.902223  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1934  hypothetical protein  26.36 
 
 		 491 aa  56.2  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  32.62 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  36.99 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40300  hypothetical protein  39.47 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  28.45 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1421  XRE family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0333143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  39.19 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2107  XRE family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.211788 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0852  Cro/CI family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  25.89 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2233  hypothetical protein  39.71 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.683193  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  27.54 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2893  cytoskeletal protein RodZ  26.07 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0288  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.504804 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  41.27 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>