More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0627 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 624 aa  1214    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  77.85 
 
 		 296 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0707  cytochrome oxidase assembly  65.06 
 
 		 317 aa  355  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  61.06 
 
 		 312 aa  331  3e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  35.5 
 
 		 622 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  49.31 
 
 		 318 aa  274  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  47.06 
 
 		 337 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  49.82 
 
 		 535 aa  247  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  50.54 
 
 		 534 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  50.82 
 
 		 302 aa  244  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  49.14 
 
 		 317 aa  241  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  44.97 
 
 		 321 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  48.58 
 
 		 323 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  48.94 
 
 		 323 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  49.65 
 
 		 323 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0213  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 		 318 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0224  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 		 318 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  44.59 
 
 		 443 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  45.92 
 
 		 306 aa  219  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  50.35 
 
 		 318 aa  216  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  42.68 
 
 		 328 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  48.34 
 
 		 586 aa  213  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  46.59 
 
 		 324 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  44.44 
 
 		 307 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0200  cytochrome oxidase assembly protein  49.3 
 
 		 316 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.571706  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  45.8 
 
 		 304 aa  208  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 		 302 aa  207  4e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 		 312 aa  207  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  46.48 
 
 		 333 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  46.48 
 
 		 333 aa  207  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  46.48 
 
 		 310 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  43.94 
 
 		 316 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  45.2 
 
 		 317 aa  206  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  44.8 
 
 		 335 aa  206  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  43.42 
 
 		 293 aa  205  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  41.35 
 
 		 318 aa  205  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  45.52 
 
 		 308 aa  205  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  48.23 
 
 		 328 aa  205  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 303 aa  204  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  43.6 
 
 		 316 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  43.62 
 
 		 326 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  44.72 
 
 		 294 aa  204  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  40.89 
 
 		 315 aa  203  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 		 299 aa  203  7e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  44.08 
 
 		 319 aa  203  8e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  38.79 
 
 		 321 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 301 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  41.02 
 
 		 303 aa  200  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  41.7 
 
 		 311 aa  200  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  41.43 
 
 		 297 aa  200  7.999999999999999e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  40.67 
 
 		 301 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  43.31 
 
 		 289 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  43.13 
 
 		 341 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  43.88 
 
 		 339 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  44.88 
 
 		 301 aa  198  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  43.6 
 
 		 305 aa  198  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 		 315 aa  198  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  40.96 
 
 		 305 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 		 316 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  40.56 
 
 		 301 aa  197  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  42.61 
 
 		 317 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  41.89 
 
 		 301 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  45.16 
 
 		 353 aa  196  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  45.99 
 
 		 296 aa  196  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  39.43 
 
 		 306 aa  196  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  39.43 
 
 		 306 aa  196  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  40.21 
 
 		 305 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  44.25 
 
 		 304 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  41.28 
 
 		 297 aa  195  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  44.25 
 
 		 304 aa  196  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  42.48 
 
 		 342 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  40.96 
 
 		 317 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  45.16 
 
 		 312 aa  194  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  48.4 
 
 		 297 aa  194  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  44.21 
 
 		 313 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  41.89 
 
 		 301 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  41.89 
 
 		 301 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  41.89 
 
 		 301 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  37.46 
 
 		 302 aa  194  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  43.82 
 
 		 326 aa  194  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  43.09 
 
 		 328 aa  193  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  43.09 
 
 		 328 aa  193  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  40.6 
 
 		 311 aa  193  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 302 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 		 300 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  44.26 
 
 		 309 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 		 307 aa  192  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 		 325 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  41.89 
 
 		 300 aa  192  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0545  cytochrome oxidase assembly  48.23 
 
 		 335 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  43.79 
 
 		 312 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  41.22 
 
 		 300 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  41.22 
 
 		 300 aa  190  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  44.44 
 
 		 299 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  39.44 
 
 		 298 aa  189  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  38.87 
 
 		 301 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  44.84 
 
 		 313 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 		 313 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  43.82 
 
 		 313 aa  188  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  41 
 
 		 302 aa  188  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>