132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02953 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3466  transposase Tn3 family protein  98.68 
 
 		 992 aa  1704    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3469  transposase Tn3 family protein  98.68 
 
 		 883 aa  1706    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  47.73 
 
 		 1006 aa  803    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02953  Transposase Tn3  100 
 
 		 831 aa  1726    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.225091  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01418  Transposase Tn3  93.23 
 
 		 458 aa  594  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000173243  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  31.81 
 
 		 1015 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  31.1 
 
 		 1018 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  30.84 
 
 		 1028 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  30.84 
 
 		 1026 aa  366  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  30.84 
 
 		 1026 aa  366  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  30.72 
 
 		 1028 aa  365  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  31.8 
 
 		 929 aa  356  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4490  transposase Tn3 family protein  28.83 
 
 		 1010 aa  336  9e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.666147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4353  transposase Tn3 family protein  28.83 
 
 		 1010 aa  336  9e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4478  transposase Tn3 family protein  28.12 
 
 		 1009 aa  335  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000650614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5340  transposase  28.12 
 
 		 1009 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1476  transposase Tn3 family protein  28.12 
 
 		 1009 aa  335  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000034033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1851  transposase Tn3 family protein  28.12 
 
 		 1009 aa  335  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000277691 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6457  transposase Tn3  28.01 
 
 		 1008 aa  331  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02961  putative transposase  99.24 
 
 		 259 aa  279  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000274404  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0051  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1015 aa  261  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.107009  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  22.29 
 
 		 1019 aa  139  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  24.47 
 
 		 968 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01406  Transposase Tn3  52.29 
 
 		 267 aa  117  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  20.53 
 
 		 1020 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  22.8 
 
 		 985 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  23.47 
 
 		 976 aa  100  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  27.33 
 
 		 988 aa  100  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  23.33 
 
 		 924 aa  100  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  27.97 
 
 		 997 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  23.59 
 
 		 1019 aa  100  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  28.46 
 
 		 1029 aa  99  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  21.26 
 
 		 990 aa  99  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  27.2 
 
 		 1006 aa  98.6  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  27.7 
 
 		 988 aa  98.6  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  20.97 
 
 		 990 aa  97.8  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  20.97 
 
 		 990 aa  97.8  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  20.97 
 
 		 990 aa  97.8  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  20.97 
 
 		 990 aa  96.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  21.31 
 
 		 990 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  21.31 
 
 		 990 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6928  transposase Tn3 family protein  24.87 
 
 		 1027 aa  95.1  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  26.67 
 
 		 771 aa  94.7  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  20.9 
 
 		 988 aa  92  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  21.58 
 
 		 964 aa  91.7  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  21.34 
 
 		 988 aa  90.9  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  23.27 
 
 		 988 aa  90.5  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  21.57 
 
 		 988 aa  89.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  21.57 
 
 		 988 aa  89.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  21.57 
 
 		 988 aa  89.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  21.4 
 
 		 988 aa  88.6  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  22.71 
 
 		 983 aa  88.6  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  21.34 
 
 		 989 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  21.31 
 
 		 989 aa  87.8  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  22.1 
 
 		 877 aa  87  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  25.74 
 
 		 991 aa  85.9  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  25.74 
 
 		 991 aa  85.9  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  28.05 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  26.84 
 
 		 991 aa  84.7  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  26.84 
 
 		 991 aa  84.7  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  25 
 
 		 1028 aa  84.7  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  24.03 
 
 		 988 aa  84  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  24.03 
 
 		 988 aa  84  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  29.38 
 
 		 916 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  22.2 
 
 		 755 aa  82.8  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  20.9 
 
 		 988 aa  82.4  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  20.02 
 
 		 988 aa  82  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  20.02 
 
 		 988 aa  82  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  20.02 
 
 		 988 aa  82  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  20.02 
 
 		 988 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  27.38 
 
 		 988 aa  81.6  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  25.69 
 
 		 573 aa  82  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  23.88 
 
 		 988 aa  80.9  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  23.88 
 
 		 988 aa  80.9  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  25 
 
 		 988 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  24.37 
 
 		 988 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  24.42 
 
 		 606 aa  79.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  23.83 
 
 		 1015 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  25.18 
 
 		 994 aa  77.4  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  24.5 
 
 		 999 aa  75.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  24.88 
 
 		 994 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  24.88 
 
 		 994 aa  74.3  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  24.52 
 
 		 961 aa  73.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  24.88 
 
 		 862 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  24.86 
 
 		 546 aa  73.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  23.14 
 
 		 1075 aa  73.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  25.07 
 
 		 772 aa  72.4  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  24.81 
 
 		 550 aa  70.9  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  24.81 
 
 		 992 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  24.81 
 
 		 992 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  22.74 
 
 		 996 aa  66.6  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  21.74 
 
 		 992 aa  63.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3764  Tn3 family transposase  33.66 
 
 		 154 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  21.03 
 
 		 987 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  27.95 
 
 		 838 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  22.74 
 
 		 996 aa  62.4  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  22.74 
 
 		 996 aa  62.4  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  22.74 
 
 		 996 aa  62.4  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  27.55 
 
 		 986 aa  60.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  20.31 
 
 		 983 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>