More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00424 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00424  putative hydrolase/phosphatase protein  100 
 
 		 172 aa  358  3e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3247  HAD family hydrolase  53.57 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0759  HAD family hydrolase  48.47 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001470  HAD-superfamily hydrolase  47.31 
 
 		 206 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05409  phosphoglycolate phosphatase  44.31 
 
 		 204 aa  154  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2257  HAD family hydrolase  48.77 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0523  hydrolase, HAD-family protein  48.12 
 
 		 203 aa  151  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0171673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2703  HAD family hydrolase  43.37 
 
 		 197 aa  151  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.776642  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0412  HAD family hydrolase  48.41 
 
 		 209 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0574  HAD family hydrolase  41.57 
 
 		 204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0803877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0550  HAD family hydrolase  41.57 
 
 		 204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.96 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3760  HAD family hydrolase  40.96 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0635  HAD family hydrolase  40.36 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3426  HAD family hydrolase  41.1 
 
 		 203 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4039  HAD superfamily hydrolase  40.49 
 
 		 202 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0526  HAD family hydrolase  40.49 
 
 		 210 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3600  HAD family hydrolase  40.49 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0499  HAD superfamily hydrolase  39.75 
 
 		 204 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0371  HAD family hydrolase  37.72 
 
 		 205 aa  131  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  32.69 
 
 		 214 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  32.08 
 
 		 184 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1167  hypothetical protein  32.75 
 
 		 198 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12890  hypothetical protein  32.75 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.753603  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4761  HAD superfamily hydrolase  30.41 
 
 		 196 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000261111  hitchhiker  0.00232434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4635  HAD family hydrolase  30.41 
 
 		 196 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.262111  hitchhiker  0.00233323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4773  HAD family hydrolase  30.23 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.330372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0659  HAD family hydrolase  30.99 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0468832  normal  0.394115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4915  HAD family hydrolase  30.99 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000596857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87850  predicted protein  31.87 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.762716  normal  0.0707375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.93 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0546  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.06 
 
 		 319 aa  78.6  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2814  HAD family hydrolase  31.48 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1559  HAD family hydrolase  31.85 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.815546  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1113  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.34 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3457  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.18 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.49 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3718  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5811  predicted protein  31.13 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.695872  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1688  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  30.91 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168366  normal  0.420144 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.71 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.25 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0707  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.58 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3448  HAD family hydrolase  30.38 
 
 		 209 aa  62  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.14 
 
 		 217 aa  60.8  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.077596  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  27.75 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0581  HAD family hydrolase  25.71 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.696178  normal  0.657435 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.93 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  30.85 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3208  hydrolase  25.97 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.67 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.45426  normal  0.439301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  29.13 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2083  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.85 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.946947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.86 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1710  HAD family hydrolase  27.53 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2190  HAD family hydrolase  25.42 
 
 		 234 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 232 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1535  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.44 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.918107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  29.55 
 
 		 219 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3540  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.59 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  0.491386 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2777  putative phosphatase  27.33 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.779945  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  30.32 
 
 		 243 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1487  putative phosphatase  27.78 
 
 		 224 aa  52  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.751605  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.27 
 
 		 218 aa  51.6  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  25.56 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  27.59 
 
 		 209 aa  51.6  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  25.65 
 
 		 225 aa  51.2  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 225 aa  51.2  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 225 aa  51.2  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  28.35 
 
 		 225 aa  51.2  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  26.8 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  29.12 
 
 		 225 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  26.55 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  21.86 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.73 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  26.34 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0261  phosphoglycolate phosphatase, C-terminal region  34.09 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.450008  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0962  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.37 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.27 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  27.13 
 
 		 234 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  26.34 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  27.37 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  26.52 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00720904  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.47 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  26.78 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  26.4 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06771  phosphatase/phosphohexomutase  24.73 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  26.98 
 
 		 231 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  25.56 
 
 		 223 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  27.78 
 
 		 215 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 230 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>