More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0096 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  331  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  67.79 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 160 aa  190  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  59.49 
 
 		 163 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 171 aa  177  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0559  AsnC family transcriptional regulator  58.13 
 
 		 162 aa  176  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  60.13 
 
 		 161 aa  174  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1081  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0619  transcriptional regulator, AsnC family  62.5 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0640  AsnC family transcriptional regulator  63.12 
 
 		 163 aa  167  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  58.5 
 
 		 163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  58.5 
 
 		 163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 163 aa  160  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 163 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  57.34 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  57.34 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  57.34 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  57.34 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  57.34 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  57.34 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  37.33 
 
 		 173 aa  111  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  37.33 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 160 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  38.31 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  38.31 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 157 aa  104  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 155 aa  101  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 162 aa  99.8  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1629  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00470119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 159 aa  97.4  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 161 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0764  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267919  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  37.82 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  42.25 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  34 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  37.18 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 160 aa  95.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0399  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  34 
 
 		 155 aa  94.4  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 154 aa  94.4  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 170 aa  94  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 164 aa  94  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  37.5 
 
 		 158 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  41.46 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4492  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  33.99 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.06 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 		 167 aa  92  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  37.06 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  37.06 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 152 aa  91.7  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 		 167 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>