More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07640 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 588 aa  1139    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8453  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  44.92 
 
 		 564 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00619084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5182  ABC transporter related  48.55 
 
 		 578 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.459442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2082  ABC transporter transmembrane region  46.38 
 
 		 575 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3041  ABC transporter transmembrane region  44.06 
 
 		 615 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0748  ABC transporter transmembrane region  49.05 
 
 		 593 aa  418  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28420  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.22 
 
 		 607 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.520014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2573  ABC transporter related protein  46.56 
 
 		 619 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0847371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0647  ABC transporter transmembrane region  40.53 
 
 		 589 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.415337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0419  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 574 aa  363  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.937876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0698  ABC transporter transmembrane region  42.03 
 
 		 612 aa  360  6e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4060  ABC transporter related protein  39.35 
 
 		 570 aa  347  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.282527  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3727  ABC transporter related  39.07 
 
 		 578 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202459  normal  0.0336359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4196  ABC transporter transmembrane region  39.62 
 
 		 580 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00643785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1127  ABC transporter transmembrane region  42.73 
 
 		 580 aa  300  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3472  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.55 
 
 		 564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00244165  hitchhiker  0.00122928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6064  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 575 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1593  ABC transporter related protein  34.43 
 
 		 587 aa  164  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.317799  normal  0.0625099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.6 
 
 		 600 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2406  ABC transporter related  31.44 
 
 		 570 aa  153  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.799079 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  23.43 
 
 		 597 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.98 
 
 		 613 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  24.05 
 
 		 609 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5067  ABC transporter related  36.77 
 
 		 549 aa  151  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  29.03 
 
 		 581 aa  150  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.21 
 
 		 583 aa  149  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  27.07 
 
 		 601 aa  150  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  25.57 
 
 		 590 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  23.59 
 
 		 582 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  30.73 
 
 		 631 aa  148  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3048  ABC transporter related  29.7 
 
 		 584 aa  148  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0856  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  31.09 
 
 		 566 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  26.11 
 
 		 556 aa  147  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  29.19 
 
 		 603 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  30.72 
 
 		 1522 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  27.94 
 
 		 603 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  27.78 
 
 		 606 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  28.73 
 
 		 614 aa  144  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  24.67 
 
 		 589 aa  144  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  26.26 
 
 		 640 aa  144  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  27.25 
 
 		 587 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01280  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.01 
 
 		 530 aa  143  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.92 
 
 		 1257 aa  143  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  25.26 
 
 		 578 aa  143  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  30.7 
 
 		 596 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.1 
 
 		 589 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  27.3 
 
 		 598 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3122  ABC transporter-like protein protein  27.21 
 
 		 609 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  25.47 
 
 		 586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.66 
 
 		 622 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4984  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.4 
 
 		 602 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.47 
 
 		 586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.39 
 
 		 583 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0531  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.96 
 
 		 603 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.140782 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  24.74 
 
 		 589 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  25.4 
 
 		 608 aa  140  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.12 
 
 		 602 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  25.24 
 
 		 586 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0536  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  26.94 
 
 		 600 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.742929 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.24 
 
 		 586 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4935  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.21 
 
 		 602 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.302825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  26.17 
 
 		 586 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  25.24 
 
 		 586 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  29.18 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.59 
 
 		 586 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.65 
 
 		 586 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  25 
 
 		 600 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  24.65 
 
 		 588 aa  139  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25 
 
 		 582 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  23.25 
 
 		 597 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1118  ABC transporter, transmembrane region  25.65 
 
 		 606 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  28.74 
 
 		 583 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25 
 
 		 597 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.59 
 
 		 721 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4984  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.43 
 
 		 624 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  25.12 
 
 		 586 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.94 
 
 		 586 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  28.88 
 
 		 593 aa  137  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.62 
 
 		 590 aa  137  5e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  26.13 
 
 		 594 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  24.51 
 
 		 566 aa  137  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0359  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.11 
 
 		 635 aa  137  8e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.101068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  23 
 
 		 573 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  25.18 
 
 		 594 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25 
 
 		 579 aa  136  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  30.19 
 
 		 597 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3689  ABC transporter related protein  30.95 
 
 		 560 aa  136  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  24.01 
 
 		 617 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  24.51 
 
 		 593 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.55 
 
 		 634 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  24.44 
 
 		 580 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.39 
 
 		 581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  23.09 
 
 		 613 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  24.6 
 
 		 699 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  23.7 
 
 		 579 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1094  ABC transporter related protein  27.21 
 
 		 584 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.854405  normal  0.257792 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.7 
 
 		 586 aa  135  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  23.7 
 
 		 579 aa  134  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0422  ABC transporter related  24.29 
 
 		 606 aa  135  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3307  ABC transporter related  26.12 
 
 		 585 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233866  decreased coverage  0.00000537626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>