88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06260 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  100 
 
 		 265 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1015  formate/nitrate transporter  52.02 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1061  formate/nitrite transporter  59.18 
 
 		 270 aa  255  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  53.19 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3719  formate/nitrate transporter  53.45 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3659  formate/nitrate transporter  53.45 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.02842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3646  formate/nitrate transporter  53.45 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31093  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15970  formate/nitrite transporter family protein  62.31 
 
 		 226 aa  211  9e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3500  formate/nitrite family of transporters-like protein  51.2 
 
 		 276 aa  204  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.999349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  32.63 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  24.31 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  29.55 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  29.44 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  29.11 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  28.74 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  28.63 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  34.06 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  27.8 
 
 		 311 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  25 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  25 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  25 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  25.4 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  37.59 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  24.6 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  24.6 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  24.6 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  24.6 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  29.08 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  23.99 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  26.46 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  24.79 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  26.19 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  29.94 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  32.12 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  31.94 
 
 		 732 aa  55.8  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  29.57 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  30.3 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  32.19 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  26.56 
 
 		 325 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  31.39 
 
 		 318 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  36.67 
 
 		 625 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  30.71 
 
 		 346 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  33.33 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  26.92 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  30.71 
 
 		 361 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  27.69 
 
 		 483 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  27.73 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  30.25 
 
 		 289 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  27.04 
 
 		 284 aa  50.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  25.1 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  24.62 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  26.57 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  29.09 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  31.37 
 
 		 425 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  30.7 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  34.21 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  28.46 
 
 		 483 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  26.7 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1997  formate/nitrite transporter family protein  25.86 
 
 		 273 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  28.8 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  28.49 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  34.29 
 
 		 263 aa  45.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  27.1 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  26.87 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  36.11 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  44.29 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  23.97 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  30.91 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  29.31 
 
 		 483 aa  43.9  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  27.93 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  27.46 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  22.9 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  27 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  36.84 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  23.77 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  26.12 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  32.26 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  30.69 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  24.88 
 
 		 289 aa  42  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  27.46 
 
 		 324 aa  42  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  26.76 
 
 		 324 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.141715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>