More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04640 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  100 
 
 		 958 aa  1900    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  44.61 
 
 		 843 aa  652    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  44.75 
 
 		 840 aa  660    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  42.43 
 
 		 854 aa  599  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  48 
 
 		 1092 aa  592  1e-168  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  45.39 
 
 		 832 aa  469  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  42.2 
 
 		 779 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  44.92 
 
 		 728 aa  452  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  42.31 
 
 		 731 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  41.79 
 
 		 920 aa  432  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  43.12 
 
 		 723 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  42.46 
 
 		 772 aa  429  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  44.33 
 
 		 735 aa  429  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  42.46 
 
 		 772 aa  429  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  45.63 
 
 		 737 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  42.46 
 
 		 772 aa  429  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  46 
 
 		 755 aa  425  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  43.07 
 
 		 784 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  38.33 
 
 		 779 aa  422  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  39.78 
 
 		 734 aa  419  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  44.86 
 
 		 917 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  43.19 
 
 		 793 aa  396  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  43.19 
 
 		 734 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  45.36 
 
 		 1002 aa  391  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  40.49 
 
 		 735 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  40.2 
 
 		 732 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  37.78 
 
 		 842 aa  362  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  37.5 
 
 		 1382 aa  361  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  40.71 
 
 		 909 aa  361  4e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  41.83 
 
 		 734 aa  360  5e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  57.44 
 
 		 791 aa  356  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  41.09 
 
 		 807 aa  355  2.9999999999999997e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  41.12 
 
 		 724 aa  353  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  34.52 
 
 		 743 aa  352  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  39.57 
 
 		 729 aa  350  9e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  36.55 
 
 		 742 aa  345  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  42.83 
 
 		 1058 aa  345  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  33.98 
 
 		 893 aa  344  4e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  47.19 
 
 		 787 aa  342  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  32.56 
 
 		 760 aa  339  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  34.96 
 
 		 704 aa  335  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  48.18 
 
 		 787 aa  336  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  41.96 
 
 		 732 aa  323  9.000000000000001e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  41.72 
 
 		 726 aa  320  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  39.45 
 
 		 738 aa  315  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  33.6 
 
 		 737 aa  312  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.49 
 
 		 746 aa  304  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  41.79 
 
 		 737 aa  301  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  33.53 
 
 		 735 aa  301  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  31.03 
 
 		 781 aa  293  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  36.82 
 
 		 717 aa  291  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  33.93 
 
 		 876 aa  291  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  33.53 
 
 		 732 aa  291  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  35.67 
 
 		 718 aa  290  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  35.53 
 
 		 751 aa  288  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  39.31 
 
 		 829 aa  288  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  39.31 
 
 		 829 aa  288  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  36.1 
 
 		 752 aa  283  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  37.13 
 
 		 761 aa  283  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  32.46 
 
 		 723 aa  282  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  41.4 
 
 		 735 aa  280  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  45.21 
 
 		 903 aa  271  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  35.08 
 
 		 758 aa  270  8e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  41.13 
 
 		 729 aa  268  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  36.43 
 
 		 714 aa  263  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  33.5 
 
 		 740 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  35.82 
 
 		 743 aa  252  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.97 
 
 		 796 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  46.28 
 
 		 903 aa  240  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  29.53 
 
 		 978 aa  227  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  37.22 
 
 		 749 aa  224  4.9999999999999996e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  28.41 
 
 		 979 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  47.7 
 
 		 726 aa  224  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  28.41 
 
 		 983 aa  224  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  28.41 
 
 		 983 aa  224  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  40.3 
 
 		 724 aa  220  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  40.12 
 
 		 715 aa  218  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  25.67 
 
 		 758 aa  209  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  29.21 
 
 		 805 aa  208  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  38.21 
 
 		 726 aa  207  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  40.22 
 
 		 776 aa  206  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  29.33 
 
 		 966 aa  205  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  29.3 
 
 		 968 aa  202  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  28.51 
 
 		 741 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  28.08 
 
 		 736 aa  201  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  43.17 
 
 		 841 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  29.06 
 
 		 737 aa  196  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  28.77 
 
 		 1155 aa  193  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  29.23 
 
 		 743 aa  191  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  29.87 
 
 		 733 aa  189  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6982  MMPL domain protein  29.05 
 
 		 794 aa  188  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  29.3 
 
 		 766 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  28.62 
 
 		 770 aa  184  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  29.09 
 
 		 757 aa  180  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  26.21 
 
 		 740 aa  179  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  29.37 
 
 		 796 aa  177  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  29.22 
 
 		 737 aa  177  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.24 
 
 		 738 aa  178  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  30.47 
 
 		 731 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  35.25 
 
 		 836 aa  174  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>