More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3941 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3941  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 
233 aa  434  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000468368 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4510  60 kDa inner membrane insertion protein  35.74 
 
 
337 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2555  60 kDa inner membrane insertion protein  36.51 
 
 
315 aa  150  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000456374  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38030  preprotein translocase subunit YidC  35.74 
 
 
365 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3727  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.59 
 
 
384 aa  138  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0259418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3934  60 kDa inner membrane insertion protein  30.71 
 
 
324 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000149067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3376  60 kDa inner membrane insertion protein  33.87 
 
 
314 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2751  60 kDa inner membrane insertion protein  38.74 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3047  60 kDa inner membrane insertion protein  32.08 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000560041  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4169  60 kDa inner membrane insertion protein  29.7 
 
 
324 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.746972  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31950  preprotein translocase subunit YidC  31.91 
 
 
366 aa  125  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_27010  preprotein translocase subunit YidC  31.05 
 
 
350 aa  120  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4222  60 kDa inner membrane insertion protein  35.14 
 
 
382 aa  119  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127281  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1439  preprotein translocase subunit  27.87 
 
 
335 aa  113  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23450  preprotein translocase subunit YidC  33.9 
 
 
332 aa  110  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4697  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.84 
 
 
363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.164692  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  30.61 
 
 
308 aa  105  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  30.17 
 
 
316 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  31.96 
 
 
246 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4590  60 kDa inner membrane insertion protein  29.96 
 
 
370 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  hitchhiker  0.000511998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6484  60 kDa inner membrane insertion protein  32.51 
 
 
366 aa  98.6  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0489623  normal  0.0985763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.54 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5108  60 kDa inner membrane insertion protein  30.17 
 
 
338 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.3246  unclonable  0.0000000218761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.94 
 
 
309 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  28.24 
 
 
553 aa  95.9  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.48 
 
 
553 aa  95.5  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3593  60 kDa inner membrane insertion protein  26.86 
 
 
318 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.694867  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.34 
 
 
555 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.62 
 
 
554 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.62 
 
 
554 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4793  protein translocase subunit yidC  27.14 
 
 
565 aa  92.4  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  33.77 
 
 
315 aa  91.7  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4140  protein translocase subunit yidC  28.1 
 
 
570 aa  91.3  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.555817 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39770  preprotein translocase subunit YidC  30.9 
 
 
346 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00795721  normal  0.66233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  29.52 
 
 
553 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  29.17 
 
 
351 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5412  60 kDa inner membrane insertion protein  25 
 
 
385 aa  89.4  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.83 
 
 
565 aa  89  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3542  YidC translocase/secretase  27.62 
 
 
569 aa  89.4  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5012  60 kDa inner membrane insertion protein  27.08 
 
 
567 aa  89  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9053  60 kDa inner membrane insertion protein  27.71 
 
 
328 aa  88.6  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.514683 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.66 
 
 
366 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  26.64 
 
 
268 aa  88.6  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.71 
 
 
541 aa  88.6  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  27.83 
 
 
557 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  30 
 
 
559 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.27 
 
 
531 aa  87.8  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5299  60 kDa inner membrane insertion protein  27.62 
 
 
565 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.477817  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.35 
 
 
555 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.83 
 
 
565 aa  87.4  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2731  60 kDa inner membrane insertion protein  26.74 
 
 
334 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450801  normal  0.193827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  26.42 
 
 
255 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  26.32 
 
 
255 aa  85.9  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6056  60 kDa inner membrane insertion protein  27.14 
 
 
570 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4865  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.4 
 
 
314 aa  85.5  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00439173  hitchhiker  0.00579415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.06 
 
 
560 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.06 
 
 
560 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.06 
 
 
560 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  26.05 
 
 
255 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  28.08 
 
 
271 aa  85.1  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.58 
 
 
536 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.81 
 
 
578 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.06 
 
 
560 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0136  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.73 
 
 
533 aa  84.3  0.000000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.170147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.24 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  26.42 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  26.42 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  26.42 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.58 
 
 
544 aa  84.3  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  27.36 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  26.42 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  26.42 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0049  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  23.05 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  26.32 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  26.51 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.35 
 
 
578 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.41 
 
 
541 aa  83.2  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  28.19 
 
 
461 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  29.23 
 
 
462 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  26.51 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.77 
 
 
560 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  25.91 
 
 
278 aa  82  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.8 
 
 
595 aa  82  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5093  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.32 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  27.67 
 
 
545 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.36 
 
 
532 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  27.01 
 
 
531 aa  80.9  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.11 
 
 
518 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  24.51 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4861  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  25.61 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  28.5 
 
 
542 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  25.24 
 
 
628 aa  79.7  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  27.07 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  25.11 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.09 
 
 
581 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.65 
 
 
517 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.69 
 
 
543 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.69 
 
 
541 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  22.67 
 
 
579 aa  79.3  0.00000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  26.19 
 
 
552 aa  79.3  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>