More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3778 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  100 
 
 		 233 aa  447  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  73.3 
 
 		 305 aa  309  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  71.06 
 
 		 259 aa  299  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  66.81 
 
 		 280 aa  266  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  63.33 
 
 		 357 aa  260  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  62.04 
 
 		 280 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  57.94 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3127  ABC transporter related protein  64.86 
 
 		 289 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0957069  decreased coverage  0.0000103375 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  62.39 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.53 
 
 		 241 aa  235  5.0000000000000005e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.602292  normal  0.126496 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.81 
 
 		 242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  57.48 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  57.87 
 
 		 228 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  56.31 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0526  ABC transporter related  54.82 
 
 		 237 aa  224  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  52.25 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02440  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.4 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.233481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  55.71 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  53.98 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  49.13 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3828  ABC transporter related  56.95 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0596278  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  53 
 
 		 225 aa  205  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  53 
 
 		 225 aa  205  6e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  50.44 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  45.45 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.45 
 
 		 264 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  54.67 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  44.59 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.44 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1467  ABC transporter related  49.77 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  46.15 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  44.59 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  47.06 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  49.56 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.49 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  48.02 
 
 		 245 aa  194  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 		 242 aa  194  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  47.6 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  49.55 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1342  ABC transporter related  54.21 
 
 		 242 aa  192  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  49.12 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  48.92 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  48 
 
 		 671 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.46 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.26 
 
 		 239 aa  191  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  50.99 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.31 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  48.65 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  51.17 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  46.77 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  50.45 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 262 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  45.62 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  51.12 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  48.66 
 
 		 291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  53.78 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  52.68 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  53.14 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  52.29 
 
 		 219 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.78 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  50.23 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  51.56 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3170  ABC transporter related protein  44.06 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0178954  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.78 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  48.34 
 
 		 653 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  52.38 
 
 		 266 aa  187  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  48.9 
 
 		 252 aa  187  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  43.78 
 
 		 227 aa  187  9e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  41.15 
 
 		 248 aa  187  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  48.06 
 
 		 654 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.5 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1041  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.49 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.658094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.5 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  40.54 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.91 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  53.77 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  42.01 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.29 
 
 		 253 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  45.69 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  43.69 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  49.51 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.29 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.5 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.76 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  51.33 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  47.03 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  44 
 
 		 226 aa  185  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  46.05 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.04 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 249 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 249 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.18 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3580  ABC transporter related protein  52.22 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  49.52 
 
 		 269 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  46.58 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  46.08 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>