86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2920 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 263 aa  477  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  57.2 
 
 		 304 aa  228  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  50.38 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  48.71 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  54.86 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  49.1 
 
 		 264 aa  189  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  48.41 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  55.06 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  52.5 
 
 		 269 aa  174  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  50.56 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  59.75 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  48.62 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  52.72 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  48.83 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  46.69 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  56.22 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  49.41 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  47.86 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  46.99 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  50.2 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43.89 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  43.03 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  45.06 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  41.09 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  45.38 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  43.89 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43.89 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43.51 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  38.56 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  41.77 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  36.73 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  29.58 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  27.38 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  28.98 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  26.79 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  32.45 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  25.8 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  38.3 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  37.63 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  35.78 
 
 		 437 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 		 297 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  38.54 
 
 		 292 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  29.31 
 
 		 280 aa  49.3  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 281 aa  49.3  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 257 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.29 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  26.4 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  21.13 
 
 		 338 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  38.14 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  35.09 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  34.82 
 
 		 290 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  37.23 
 
 		 263 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  26.97 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 231 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  36.17 
 
 		 286 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 367 aa  45.4  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  36.17 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  41.07 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  35.11 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  41.07 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  28.06 
 
 		 443 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  35.11 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  27.98 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0671  ABC-2 type transporter  30.94 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000519244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  27.83 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  22.84 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22030  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.47 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0900218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 285 aa  42.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  31.07 
 
 		 284 aa  42.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3004  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 		 259 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000399849  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 375 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>