More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2536 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  100 
 
 		 807 aa  1566    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  55.53 
 
 		 732 aa  624  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  50.66 
 
 		 737 aa  581  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  46.45 
 
 		 1058 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  46.51 
 
 		 729 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  46.1 
 
 		 734 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  43.02 
 
 		 731 aa  480  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  42.51 
 
 		 728 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  43.26 
 
 		 755 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  46.97 
 
 		 726 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  43.02 
 
 		 734 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  42.9 
 
 		 735 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  46.68 
 
 		 738 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  42.97 
 
 		 723 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  43.82 
 
 		 724 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  42.76 
 
 		 735 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  41.17 
 
 		 832 aa  452  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  34.65 
 
 		 829 aa  449  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  34.65 
 
 		 829 aa  449  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  39.33 
 
 		 787 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  41.76 
 
 		 909 aa  432  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  38.48 
 
 		 779 aa  423  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  37.53 
 
 		 779 aa  422  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  39.02 
 
 		 920 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  42.95 
 
 		 1002 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  33.55 
 
 		 893 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  40.99 
 
 		 917 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  42.23 
 
 		 734 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  41.48 
 
 		 793 aa  416  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  46.98 
 
 		 726 aa  415  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  39.3 
 
 		 737 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  42.04 
 
 		 854 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  35.25 
 
 		 704 aa  404  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  37.33 
 
 		 791 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  39.3 
 
 		 772 aa  389  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  41.24 
 
 		 958 aa  389  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  39.3 
 
 		 772 aa  389  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  35.58 
 
 		 772 aa  389  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  42.7 
 
 		 1092 aa  385  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  42.88 
 
 		 840 aa  381  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  37.78 
 
 		 842 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  34.98 
 
 		 743 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  36.56 
 
 		 760 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  41.96 
 
 		 903 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  36.34 
 
 		 717 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  38.34 
 
 		 732 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  40.88 
 
 		 843 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  36.5 
 
 		 758 aa  363  6e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  37.1 
 
 		 718 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  36.45 
 
 		 735 aa  361  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  39.06 
 
 		 732 aa  361  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.98 
 
 		 746 aa  361  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  37.22 
 
 		 787 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  34.7 
 
 		 742 aa  358  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  36.69 
 
 		 752 aa  358  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.5 
 
 		 729 aa  352  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.11 
 
 		 1382 aa  351  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  36.45 
 
 		 876 aa  350  6e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  37.52 
 
 		 715 aa  348  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  40.67 
 
 		 903 aa  347  5e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  36.32 
 
 		 784 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  35.15 
 
 		 737 aa  340  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  34.55 
 
 		 726 aa  335  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  35.51 
 
 		 751 aa  331  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  34.18 
 
 		 735 aa  324  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  34.46 
 
 		 749 aa  320  7.999999999999999e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  37.2 
 
 		 724 aa  312  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  32.09 
 
 		 781 aa  308  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  34.51 
 
 		 723 aa  306  7e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  34.31 
 
 		 711 aa  294  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  31.96 
 
 		 740 aa  280  6e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  33.29 
 
 		 750 aa  280  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  34.37 
 
 		 761 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  32.18 
 
 		 796 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.74 
 
 		 979 aa  270  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.61 
 
 		 983 aa  267  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.61 
 
 		 983 aa  267  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  34.5 
 
 		 743 aa  265  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  34.02 
 
 		 714 aa  264  6e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  35.5 
 
 		 978 aa  257  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  30.7 
 
 		 968 aa  247  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  28.72 
 
 		 758 aa  242  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  31.65 
 
 		 836 aa  235  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  30.68 
 
 		 966 aa  234  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  30.57 
 
 		 710 aa  234  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  30.84 
 
 		 846 aa  231  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  30.17 
 
 		 743 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  29.12 
 
 		 733 aa  220  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.67 
 
 		 738 aa  213  9e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  28.01 
 
 		 740 aa  211  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  29.53 
 
 		 737 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  29.14 
 
 		 741 aa  209  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  30.74 
 
 		 736 aa  208  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  28.63 
 
 		 796 aa  207  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  25.36 
 
 		 730 aa  207  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  25.61 
 
 		 730 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  25.23 
 
 		 730 aa  205  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  25.23 
 
 		 730 aa  205  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  25.23 
 
 		 730 aa  205  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  25.62 
 
 		 730 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>