More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1412 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  100 
 
 		 177 aa  330  6e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  51.8 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  51.08 
 
 		 161 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  51.08 
 
 		 161 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  47.79 
 
 		 173 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  51.11 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  50 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  51.88 
 
 		 214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  47.65 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  55.65 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  51.11 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  53.38 
 
 		 164 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  52.35 
 
 		 238 aa  107  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  47.92 
 
 		 249 aa  106  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  50 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  47.1 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  51.85 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  50 
 
 		 254 aa  98.2  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  44.77 
 
 		 269 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  51.15 
 
 		 191 aa  95.5  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  48.09 
 
 		 291 aa  94.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  52.99 
 
 		 362 aa  94.4  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  37.28 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  48.31 
 
 		 331 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  41.59 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  52.38 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  44.36 
 
 		 139 aa  88.6  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  46.15 
 
 		 223 aa  87.8  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  45.08 
 
 		 203 aa  84.3  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  42.37 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  44.78 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  41.73 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.61 
 
 		 271 aa  71.6  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  29.2 
 
 		 307 aa  62  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  35.16 
 
 		 367 aa  61.6  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  33.83 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  28.78 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  30.88 
 
 		 468 aa  59.7  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  29.03 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  35.85 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  39.83 
 
 		 425 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  38.04 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  40.71 
 
 		 610 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  31.62 
 
 		 541 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  28.77 
 
 		 401 aa  55.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  39.82 
 
 		 400 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  28.31 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  32.81 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  39.82 
 
 		 421 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  38.98 
 
 		 425 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  39.82 
 
 		 421 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  34.65 
 
 		 379 aa  55.1  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  37.5 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  38.46 
 
 		 276 aa  54.7  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  27.11 
 
 		 271 aa  54.7  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  33.33 
 
 		 446 aa  54.3  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  38.39 
 
 		 412 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  38.94 
 
 		 420 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  34.71 
 
 		 388 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2138  hypothetical protein  34.68 
 
 		 409 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123403  normal  0.331255 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  32.31 
 
 		 389 aa  53.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  35.71 
 
 		 491 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  38.79 
 
 		 605 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  31.73 
 
 		 262 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  39.42 
 
 		 253 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  33.58 
 
 		 464 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  33.85 
 
 		 373 aa  52  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  28.69 
 
 		 279 aa  52  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  30.47 
 
 		 250 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  28.57 
 
 		 482 aa  52  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  29.63 
 
 		 447 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  29.63 
 
 		 447 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  34.65 
 
 		 494 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  30.47 
 
 		 250 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  30.47 
 
 		 250 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  30.47 
 
 		 250 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  32.81 
 
 		 321 aa  51.6  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1389  M24/M37 family peptidase  29.66 
 
 		 204 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000798303  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  38.68 
 
 		 454 aa  51.2  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1500  M23/37 family peptidase  29.66 
 
 		 204 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000118576  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1065  peptidase M23B  34 
 
 		 373 aa  51.2  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0161444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  38.46 
 
 		 455 aa  51.2  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3306  peptidase M23B  32 
 
 		 248 aa  51.2  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  29.69 
 
 		 250 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  26.75 
 
 		 377 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  30.37 
 
 		 446 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  26.75 
 
 		 377 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  26.75 
 
 		 377 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  26.75 
 
 		 377 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  31.25 
 
 		 491 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  26.75 
 
 		 377 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  26.61 
 
 		 379 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  32.26 
 
 		 284 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  26.61 
 
 		 379 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  26.61 
 
 		 379 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  26.61 
 
 		 379 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  27.2 
 
 		 327 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  34.38 
 
 		 299 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  28.95 
 
 		 311 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  28 
 
 		 328 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>