More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2850 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2850  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 495 aa  989    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.107434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4858  GntR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0612909 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0156  GntR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 488 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4274  GntR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 499 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1648  GntR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 495 aa  408  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3508  GntR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 489 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4017  GntR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 489 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2044  HTH-type transcriptional regulator  44.35 
 
 		 488 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1835  putative transcriptional regulator  43 
 
 		 491 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  0.359008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2022  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 509 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0071  GntR family transcriptional regulator  41.19 
 
 		 496 aa  353  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6226  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 509 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4374  putative transcriptional regulator, GntR family  40.49 
 
 		 508 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0046  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 490 aa  339  5.9999999999999996e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0157  GntR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 486 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3752  GntR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 513 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840218  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1990  GntR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 508 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0695  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 508 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0519778  hitchhiker  0.00612564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4287  GntR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00564262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0109  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.45 
 
 		 513 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290721  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3848  transcriptional regulator, GntR family  39.38 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4514  transcriptional regulator  39.23 
 
 		 509 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0025  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.02 
 
 		 494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4755  transcriptional regulator  41.58 
 
 		 501 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0135  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 527 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.868038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5672  transcriptional regulator  39.63 
 
 		 508 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1493  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 497 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.40552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 490 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  37.39 
 
 		 502 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 477 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 498 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.09 
 
 		 497 aa  231  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 473 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 491 aa  230  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 504 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.61 
 
 		 497 aa  227  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 476 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  34.37 
 
 		 488 aa  226  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.07 
 
 		 495 aa  224  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 504 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 478 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.52 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  33.26 
 
 		 499 aa  220  5e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  29.6 
 
 		 465 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 494 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 493 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  38.17 
 
 		 509 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 494 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 494 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 488 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.37 
 
 		 485 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  32.92 
 
 		 501 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0801  regulatory protein GntR, HTH  32.87 
 
 		 508 aa  216  7e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0129569  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.66 
 
 		 488 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.27 
 
 		 485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 496 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.04 
 
 		 488 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  33.74 
 
 		 490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 494 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.88 
 
 		 499 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  34.92 
 
 		 475 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 503 aa  213  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 496 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 502 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 502 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 502 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 574 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 444 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 444 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.62 
 
 		 444 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.62 
 
 		 444 aa  210  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0565  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 493 aa  210  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 444 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 502 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 489 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.45 
 
 		 515 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  32.92 
 
 		 504 aa  209  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 496 aa  209  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  33.87 
 
 		 499 aa  209  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 477 aa  209  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.66 
 
 		 496 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 501 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.67 
 
 		 514 aa  207  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 508 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.81 
 
 		 473 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 495 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  37 
 
 		 481 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 506 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4719  transcriptional regulator, GntR family  28.75 
 
 		 466 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>