126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0946 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0946  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 
369 aa  723    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3550  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  56.77 
 
 
365 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.370469  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3952  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  56.77 
 
 
360 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0242262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0504  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  53.7 
 
 
363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.483735  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2954  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  56.22 
 
 
368 aa  352  7e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.826684  normal  0.0199101 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1924  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  50.43 
 
 
360 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0724806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0599  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.16 
 
 
392 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2565  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.6 
 
 
390 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4117  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.65 
 
 
385 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1341  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.62 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.354944  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1846  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.38 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000726333 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2646  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.78 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3018  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.86 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.559203  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0188  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.42 
 
 
376 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0170  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.42 
 
 
376 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.135886  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3187  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.51 
 
 
395 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1498  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.6 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.694394  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1499  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.25 
 
 
387 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.355503  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1777  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.68 
 
 
387 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253476  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0420  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.09 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0510  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.61 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0121409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.27 
 
 
386 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4934  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.12 
 
 
379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4680  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  34.15 
 
 
380 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4717  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.69 
 
 
388 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.413844  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5795  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.96 
 
 
372 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0465  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.95 
 
 
373 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238845  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0404  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.52 
 
 
377 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.133547  normal  0.0561317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4292  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.61 
 
 
380 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390792  normal  0.0362525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4746  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.58 
 
 
392 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1775  tRNA synthetase class II (G H P and S)  28.95 
 
 
379 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349459  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0804  tRNA synthetase class II (G H P and S)  28.28 
 
 
371 aa  89.4  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0821563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 
484 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 
484 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.87 
 
 
517 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  28.49 
 
 
466 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  30.26 
 
 
479 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  24.18 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  22.69 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  23.35 
 
 
418 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 
418 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 
421 aa  62.8  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  22.75 
 
 
418 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 
427 aa  57.4  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 
419 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  35.16 
 
 
419 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  26.29 
 
 
417 aa  54.7  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  23.61 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.08 
 
 
418 aa  52.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.15 
 
 
394 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0923  Histidine--tRNA ligase  39.51 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00438339  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0606  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.45 
 
 
321 aa  50.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4470  histidyl-tRNA synthetase 2  37.4 
 
 
449 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4890  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.33 
 
 
395 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625991  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4766  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  33.33 
 
 
395 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  23.49 
 
 
426 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  24.51 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0644  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.86 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  30.53 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  26.25 
 
 
418 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4942  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.5 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2981  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.92 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  23.21 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  22.91 
 
 
420 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2627  tRNA synthetase class II (G H P and S)  28.69 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000799306 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0676  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.57 
 
 
434 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4681  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  30.71 
 
 
395 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0476  tRNA synthetase class II (G H P and S)  31.17 
 
 
381 aa  47  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108226 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  28.24 
 
 
419 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1326  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  21.84 
 
 
420 aa  46.6  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  22.94 
 
 
409 aa  46.6  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0712  histidyl-tRNA synthetase  21.66 
 
 
413 aa  46.2  0.0008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.666191  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  24.64 
 
 
444 aa  46.6  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  26.36 
 
 
421 aa  46.6  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0202  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.54 
 
 
428 aa  46.2  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000325703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  25 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65250  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.2 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5668  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.2 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863885  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  25.62 
 
 
423 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0236  histidyl-tRNA synthetase  22.67 
 
 
427 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15290  ATP phosphoribosyltransferase  24.08 
 
 
538 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0483798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  29.69 
 
 
409 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1100  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  31.52 
 
 
413 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  19.52 
 
 
456 aa  44.3  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  23.89 
 
 
418 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
423 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5103  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.62 
 
 
382 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480937  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.27 
 
 
434 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1802  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.62 
 
 
382 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  23.42 
 
 
428 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1826  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  32.62 
 
 
382 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 
423 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>