More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3333 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3333  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
422 aa  840    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1387  Extracellular ligand-binding receptor  66.59 
 
 
424 aa  534  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1418  extracellular ligand-binding receptor  37.77 
 
 
404 aa  209  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4899  Extracellular ligand-binding receptor  34.11 
 
 
442 aa  166  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1861  periplasmic binding protein of ABC transporter for natural amino acids  30.69 
 
 
421 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2091  branched-chain/neutral amino acids amide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein 1  47.95 
 
 
365 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.649007  normal  0.0283766 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1736  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  45.36 
 
 
425 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3090  Extracellular ligand-binding receptor  44.57 
 
 
425 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.989636  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1522  putative periplasmic ligand-binding protein  31.93 
 
 
395 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.371953 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3932  extracellular ligand-binding receptor  32.51 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1959  extracellular ligand-binding receptor  30.75 
 
 
418 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2873  extracellular ligand-binding receptor  30.42 
 
 
440 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.435547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4793  extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997112  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3206  Extracellular ligand-binding receptor  30.19 
 
 
440 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2915  Extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 
440 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000111325  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0868  Extracellular ligand-binding receptor  29.93 
 
 
433 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0661  Extracellular ligand-binding receptor  28.79 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29060  amino acid-binding protein  31.28 
 
 
414 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.987763  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1378  Extracellular ligand-binding receptor  29.72 
 
 
439 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1977  periplasmic binding protein  29.74 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.343651  normal  0.981595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3970  Extracellular ligand-binding receptor  30.18 
 
 
425 aa  120  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0926  extracellular ligand-binding receptor  32.87 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0603  Extracellular ligand-binding receptor  29.61 
 
 
401 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1186  branched-chain amino acid transport system substrate-binding protein  30.48 
 
 
415 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.62825  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1272  extracellular ligand-binding receptor  30.29 
 
 
399 aa  116  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.570271  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1568  extracellular ligand-binding receptor  29.95 
 
 
394 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93601  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2923  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  29.67 
 
 
394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0957  Extracellular ligand-binding receptor  30.24 
 
 
415 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2165  extracellular ligand-binding receptor  31.12 
 
 
399 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131423  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  29.28 
 
 
399 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1149  Extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 
442 aa  97.8  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1227  Extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 
424 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000229602 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  24.8 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2423  Extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 
410 aa  93.6  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0867221 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1576  extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 
427 aa  93.6  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0597639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 
426 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  27.07 
 
 
386 aa  90.9  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  25.2 
 
 
392 aa  90.1  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1154  extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 
449 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443442  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3536  extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000357876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2471  Extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 
371 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2397  extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 
372 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.285564  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  25.55 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  27.48 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0701  Extracellular ligand-binding receptor  23.67 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0183935  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6166  extracellular ligand-binding receptor  25.65 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  0.0557295 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  26.67 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.8 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0592  extracellular ligand-binding receptor  24.67 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.944632  hitchhiker  0.0000426056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1976  Extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.448031  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  26.2 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4231  Extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0480  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  23.89 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.199357  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  25.54 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3401  extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.388266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  22.4 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2892  Extracellular ligand-binding receptor  25.27 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2709  Extracellular ligand-binding receptor  23.48 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.91 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2323  extracellular ligand-binding receptor  24.39 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0104  Extracellular ligand-binding receptor  26.77 
 
 
422 aa  69.7  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3294  ABC transporter substrate binding protein (branched chain amino acid)  27.35 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0602747  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  24.84 
 
 
373 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  22.49 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.48 
 
 
399 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2867  extracellular ligand-binding receptor  23.04 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.867317  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2207  Extracellular ligand-binding receptor  25.8 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0313  Extracellular ligand-binding receptor  25.93 
 
 
497 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2319  Extracellular ligand-binding receptor  23.48 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.405352  hitchhiker  0.00559033 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3574  extracellular ligand-binding receptor  26.86 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428892  normal  0.0120005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  24.59 
 
 
394 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  23.62 
 
 
450 aa  68.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  28.88 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  24.54 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  23.14 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1548  Extracellular ligand-binding receptor  24.62 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  23.38 
 
 
371 aa  67  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 
387 aa  67  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  24.6 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0446  extracellular ligand-binding receptor  22.85 
 
 
451 aa  66.6  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.4 
 
 
402 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  24.23 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3417  extracellular ligand-binding receptor  25.64 
 
 
409 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.498074  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  23.67 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.4 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1762  extracellular ligand-binding receptor  21.84 
 
 
449 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304418  hitchhiker  0.000873526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0538  extracellular ligand-binding receptor  26.1 
 
 
368 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0513259  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.4 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.4 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  21.99 
 
 
399 aa  64.3  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.4 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2841  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 
403 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13228  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  24.74 
 
 
368 aa  64.3  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>