More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0033 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 892 aa  734    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 892 aa  642    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 910 aa  720    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 882 aa  734    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  82.94 
 
 		 926 aa  1557    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 923 aa  896    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 925 aa  1873    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 896 aa  650    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 892 aa  719    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1287  alanyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 913 aa  858    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.460274  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 892 aa  722    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 892 aa  721    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 916 aa  880    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1380  alanyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 913 aa  817    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.573615  normal  0.044569 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  74.54 
 
 		 924 aa  1399    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  74.87 
 
 		 926 aa  1384    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2186  alanyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 		 923 aa  904    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 914 aa  860    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 913 aa  867    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  73.78 
 
 		 926 aa  1358    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 915 aa  835    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 892 aa  644    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 892 aa  628  1e-178  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 899 aa  615  9.999999999999999e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 900 aa  606  9.999999999999999e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 907 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 904 aa  598  1e-169  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 		 889 aa  486  1e-135  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 878 aa  285  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  27.99 
 
 		 879 aa  285  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 		 876 aa  279  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 880 aa  277  5e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 877 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 		 878 aa  274  6e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  27.49 
 
 		 863 aa  274  7e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  27.36 
 
 		 886 aa  273  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 		 870 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 876 aa  269  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  26.92 
 
 		 886 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 859 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 867 aa  267  7e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 869 aa  267  8e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  27.14 
 
 		 886 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 		 876 aa  266  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 889 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 892 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 868 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 883 aa  263  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 		 865 aa  262  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  27.89 
 
 		 874 aa  262  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  27.55 
 
 		 879 aa  262  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 897 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1196  alanyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 875 aa  261  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00838926  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 897 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  25.43 
 
 		 865 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 879 aa  261  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  27.68 
 
 		 897 aa  261  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 879 aa  260  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3628  alanyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 		 872 aa  260  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168897  hitchhiker  0.00000464441 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 		 863 aa  259  1e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 		 863 aa  259  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 		 872 aa  259  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  26.19 
 
 		 856 aa  259  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  28.69 
 
 		 876 aa  258  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 874 aa  257  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 876 aa  257  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  28.99 
 
 		 879 aa  256  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 874 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  28.33 
 
 		 890 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  26.43 
 
 		 874 aa  255  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 874 aa  253  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  27.58 
 
 		 875 aa  253  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 		 887 aa  253  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  27.94 
 
 		 874 aa  253  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  26.74 
 
 		 880 aa  253  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 905 aa  253  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 905 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 		 874 aa  253  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  28.53 
 
 		 865 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 874 aa  251  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  26.94 
 
 		 878 aa  251  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 878 aa  251  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 		 884 aa  251  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 		 876 aa  251  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 905 aa  250  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 874 aa  250  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 882 aa  250  9e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  27.95 
 
 		 884 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  26.57 
 
 		 874 aa  249  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0223  alanyl-tRNA synthetase  29.17 
 
 		 894 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0181746 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 860 aa  249  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  27.09 
 
 		 874 aa  249  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  25.86 
 
 		 886 aa  248  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 864 aa  248  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 874 aa  248  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  27.14 
 
 		 876 aa  248  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 878 aa  248  4.9999999999999997e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 		 879 aa  247  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  28.56 
 
 		 906 aa  247  6e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  26.5 
 
 		 880 aa  247  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>