205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3571 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  47.56 
 
 
724 aa  636    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  100 
 
 
712 aa  1437    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  41.46 
 
 
701 aa  549  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  44.07 
 
 
718 aa  519  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  31.66 
 
 
725 aa  290  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  30.4 
 
 
694 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  27.91 
 
 
674 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  28.06 
 
 
708 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4469  peptidase S45 penicillin amidase  28.97 
 
 
738 aa  264  4.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.767372  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5361  penicillin acylase  28.08 
 
 
760 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.360999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  27.72 
 
 
821 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  28.36 
 
 
827 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  28.92 
 
 
827 aa  183  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  25.85 
 
 
762 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  29.8 
 
 
788 aa  173  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  26.33 
 
 
760 aa  171  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  26.39 
 
 
737 aa  170  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  30.2 
 
 
788 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  29.76 
 
 
787 aa  164  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.79 
 
 
796 aa  164  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  28.72 
 
 
787 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.95 
 
 
796 aa  163  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  22.68 
 
 
796 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  25.2 
 
 
770 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  28.21 
 
 
821 aa  161  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.79 
 
 
796 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.79 
 
 
796 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.34 
 
 
796 aa  160  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  23.75 
 
 
793 aa  160  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  23.63 
 
 
778 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  27.51 
 
 
795 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  22.63 
 
 
796 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  22.35 
 
 
796 aa  158  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  25.89 
 
 
763 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  25.8 
 
 
772 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  27.96 
 
 
795 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  29.26 
 
 
792 aa  157  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  22.52 
 
 
855 aa  154  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  28.49 
 
 
795 aa  154  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  22.15 
 
 
796 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  28.94 
 
 
795 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  24.78 
 
 
773 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  26.36 
 
 
769 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  22.72 
 
 
854 aa  148  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  27.41 
 
 
825 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.86 
 
 
796 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  22.08 
 
 
854 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  22.14 
 
 
855 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  22.31 
 
 
854 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5398  penicillin amidase  26.86 
 
 
803 aa  146  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111495  hitchhiker  0.00200209 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  27.95 
 
 
809 aa  146  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  26.06 
 
 
809 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  25.7 
 
 
809 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  21.93 
 
 
855 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  27.14 
 
 
770 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.03 
 
 
855 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  24.69 
 
 
795 aa  141  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  27.52 
 
 
789 aa  140  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  24.48 
 
 
806 aa  140  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  21.95 
 
 
860 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  25.82 
 
 
817 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  28.27 
 
 
821 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  21.4 
 
 
841 aa  138  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  24.97 
 
 
824 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  27.21 
 
 
787 aa  137  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  29.49 
 
 
804 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  26.53 
 
 
827 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  24.47 
 
 
819 aa  135  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  26.85 
 
 
786 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  25.38 
 
 
807 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  29.78 
 
 
803 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  24.13 
 
 
810 aa  130  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  24.07 
 
 
795 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  26.48 
 
 
769 aa  128  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  22.5 
 
 
808 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  24.37 
 
 
779 aa  127  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  25.21 
 
 
807 aa  127  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  26.14 
 
 
790 aa  127  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  29.56 
 
 
829 aa  125  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  24.92 
 
 
774 aa  124  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  25.08 
 
 
813 aa  124  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  26.14 
 
 
819 aa  124  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  23.79 
 
 
795 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  24.53 
 
 
818 aa  122  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  23.45 
 
 
795 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  27.99 
 
 
841 aa  121  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  23.69 
 
 
761 aa  120  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  22.97 
 
 
811 aa  120  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  26.11 
 
 
818 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  24.51 
 
 
779 aa  120  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  24.41 
 
 
779 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  24.01 
 
 
823 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  27.32 
 
 
809 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  29.27 
 
 
822 aa  117  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  27.32 
 
 
809 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  24.56 
 
 
804 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  24.12 
 
 
826 aa  115  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  27.55 
 
 
821 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  27.52 
 
 
784 aa  114  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  28.16 
 
 
812 aa  114  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>