67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1987 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1987  Protein of unknown function DUF2339, transmembrane  100 
 
 		 973 aa  1896    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0361094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1508  hypothetical protein  35.07 
 
 		 949 aa  438  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.144952  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  35.78 
 
 		 957 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0786  hypothetical protein  36.15 
 
 		 938 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1094  hypothetical protein  35.02 
 
 		 902 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0433151  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  38.42 
 
 		 989 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5166  hypothetical protein  34.67 
 
 		 939 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.095267  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  34.97 
 
 		 1146 aa  366  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  42.4 
 
 		 953 aa  343  9e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  38.86 
 
 		 1139 aa  342  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  34.99 
 
 		 1124 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  34.99 
 
 		 1130 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  34.97 
 
 		 1155 aa  338  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1674  membrane protein-like protein  44.99 
 
 		 1093 aa  332  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.956677 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  37.96 
 
 		 1133 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  36.4 
 
 		 1133 aa  314  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02114  hypothetical protein  43.33 
 
 		 774 aa  290  9e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67530  hypothetical protein  42.2 
 
 		 1201 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5847  hypothetical protein  41.57 
 
 		 1200 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227793  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1102  hypothetical protein  40.9 
 
 		 903 aa  287  5e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0350  hypothetical protein  39.74 
 
 		 1198 aa  275  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2460  hypothetical protein  38.12 
 
 		 946 aa  272  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3218  hypothetical protein  47.18 
 
 		 891 aa  270  8.999999999999999e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.311466  normal  0.319436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4945  hypothetical protein  39.6 
 
 		 1128 aa  249  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0505  membrane protein-like protein  40.25 
 
 		 1207 aa  240  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1537  hypothetical protein  39.6 
 
 		 1242 aa  222  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.896798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2282  membrane protein-like  28.07 
 
 		 1045 aa  149  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.650605  normal  0.0137094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1743  hypothetical protein  26.27 
 
 		 778 aa  140  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0602624  normal  0.707761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1663  membrane protein-like protein  28.63 
 
 		 600 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2975  membrane protein  25.72 
 
 		 833 aa  127  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2238  hypothetical protein  26.38 
 
 		 824 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1764  membrane protein  30.56 
 
 		 587 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.923243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1520  membrane protein-like protein  22.64 
 
 		 823 aa  94.7  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.115215  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2493  membrane protein-like protein  25.44 
 
 		 921 aa  89.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0413775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0315  membrane protein-like protein  28.61 
 
 		 1312 aa  78.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.170493  normal  0.126351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2804  membrane-like protein  40.16 
 
 		 941 aa  67.4  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.195505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0914  hypothetical protein  26.76 
 
 		 850 aa  65.1  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  23.03 
 
 		 934 aa  62  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  24.06 
 
 		 954 aa  62  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  24.06 
 
 		 954 aa  61.6  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000728  putative integral membrane protein  24 
 
 		 884 aa  60.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472428  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2913  membrane protein-like  23.73 
 
 		 847 aa  59.7  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.992887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  21.93 
 
 		 573 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1096  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1045 aa  53.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0967  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1048 aa  52.4  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0931  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1048 aa  51.6  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0678  hypothetical protein  26.42 
 
 		 915 aa  51.6  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0746  hypothetical protein  21.31 
 
 		 573 aa  51.2  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000103771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0929  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1048 aa  50.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2369  hypothetical protein  36.84 
 
 		 894 aa  50.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.518364  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0819  hypothetical protein  20.92 
 
 		 573 aa  49.7  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000546296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0760  hypothetical protein  21.48 
 
 		 573 aa  49.3  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00101969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  20.66 
 
 		 573 aa  49.3  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0601  hypothetical protein  20.98 
 
 		 573 aa  48.9  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000191529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  20.66 
 
 		 573 aa  49.3  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1194  hypothetical protein  22.17 
 
 		 856 aa  47.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000186085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  19.93 
 
 		 573 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0565  hypothetical protein  27.2 
 
 		 569 aa  47  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000285006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0723  hypothetical protein  21.45 
 
 		 573 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00206833  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1250  hypothetical protein  36.11 
 
 		 893 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373819  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04921  hypothetical protein  21.66 
 
 		 906 aa  46.2  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 1227 aa  46.2  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0602  hypothetical protein  20.14 
 
 		 573 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.139247  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2332  hypothetical protein  27.13 
 
 		 915 aa  45.8  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.741682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0933  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1063 aa  45.8  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4567  hypothetical protein  30.49 
 
 		 900 aa  45.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.117175 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4197  hypothetical protein  30.49 
 
 		 900 aa  45.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382569  normal  0.29939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>