98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1040 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  100 
 
 
873 aa  1795    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  73.86 
 
 
1412 aa  682    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  76.96 
 
 
700 aa  598  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  75.54 
 
 
700 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  74.09 
 
 
1342 aa  532  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  54.04 
 
 
689 aa  405  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  55.01 
 
 
696 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  53.26 
 
 
700 aa  403  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  51.37 
 
 
706 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  52.89 
 
 
703 aa  372  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  51.21 
 
 
717 aa  364  3e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  47.2 
 
 
694 aa  330  6e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  47.92 
 
 
458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  42.6 
 
 
688 aa  299  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  44.61 
 
 
717 aa  291  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  42.02 
 
 
686 aa  283  9e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  41.64 
 
 
693 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  49.82 
 
 
1059 aa  270  8.999999999999999e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  41.03 
 
 
680 aa  263  8.999999999999999e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  41.03 
 
 
682 aa  263  8.999999999999999e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  40.76 
 
 
680 aa  262  2e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  40.76 
 
 
679 aa  259  1e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  39.95 
 
 
686 aa  254  4.0000000000000004e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  40.38 
 
 
695 aa  251  4e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  41.16 
 
 
1064 aa  251  5e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  38.98 
 
 
882 aa  246  9.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  38.87 
 
 
989 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  35.99 
 
 
710 aa  225  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  41.45 
 
 
755 aa  225  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  35.99 
 
 
710 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  35.73 
 
 
710 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  34.26 
 
 
717 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  35.73 
 
 
710 aa  222  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  36.41 
 
 
676 aa  220  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  38.59 
 
 
791 aa  217  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  36.14 
 
 
672 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  36.68 
 
 
672 aa  213  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  40.07 
 
 
739 aa  213  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  36.59 
 
 
676 aa  211  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  35.6 
 
 
676 aa  211  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  42.12 
 
 
551 aa  210  8e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  41.31 
 
 
667 aa  210  8e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  39.21 
 
 
729 aa  206  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  36.77 
 
 
709 aa  205  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  37.06 
 
 
674 aa  204  5e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  37.09 
 
 
674 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  37.09 
 
 
674 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  34.42 
 
 
670 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  36.31 
 
 
674 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  42.14 
 
 
841 aa  201  7e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  37.27 
 
 
761 aa  199  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  37.5 
 
 
724 aa  197  8.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  41.88 
 
 
788 aa  196  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  37.96 
 
 
932 aa  195  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  41.03 
 
 
795 aa  196  2e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  43.24 
 
 
660 aa  195  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  34.07 
 
 
675 aa  195  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  32.35 
 
 
724 aa  193  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  38.35 
 
 
796 aa  192  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  35.89 
 
 
859 aa  192  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  34.64 
 
 
676 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  39.8 
 
 
949 aa  191  5.999999999999999e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  35.89 
 
 
876 aa  191  7e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  34.36 
 
 
668 aa  191  8e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  37.85 
 
 
707 aa  189  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  35.18 
 
 
890 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  41.61 
 
 
811 aa  190  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  38.15 
 
 
808 aa  187  6e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  38.6 
 
 
963 aa  187  9e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  42.37 
 
 
915 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  35.96 
 
 
847 aa  184  9.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  36.81 
 
 
848 aa  183  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  40.36 
 
 
618 aa  181  7e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  32.45 
 
 
710 aa  175  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  38.67 
 
 
717 aa  172  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  36.3 
 
 
556 aa  163  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  35.68 
 
 
314 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  34.26 
 
 
467 aa  137  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  32.86 
 
 
487 aa  135  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  30.66 
 
 
626 aa  111  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  30.43 
 
 
677 aa  109  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  30.43 
 
 
677 aa  109  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  34.68 
 
 
607 aa  80.9  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2124  DNA polymerase II large subunit  25.23 
 
 
1285 aa  79  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0126  DNA polymerase II large subunit  25.36 
 
 
1307 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0150  DNA polymerase II large subunit  30.38 
 
 
1366 aa  67.4  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0763  DNA polymerase II, large subunit DP2  32.35 
 
 
1373 aa  64.7  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.107961  normal  0.449591 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1995  DNA polymerase II, large subunit DP2  28.65 
 
 
1481 aa  61.6  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2435  DNA polymerase II large subunit  30.56 
 
 
1286 aa  60.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2254  DNA polymerase II large subunit  27.22 
 
 
1283 aa  59.7  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.413677 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  29.05 
 
 
610 aa  57.8  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0653  DnaB domain-containing protein  29.44 
 
 
1098 aa  57  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  28.49 
 
 
610 aa  56.2  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0041  replicative DNA helicase  29.94 
 
 
585 aa  53.5  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  31.25 
 
 
1523 aa  53.5  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3529  replicative DNA helicase  27.37 
 
 
593 aa  51.6  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1462  primary replicative DNA helicase  23.33 
 
 
2605 aa  51.2  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.695864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  50 
 
 
1531 aa  45.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.706415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>