22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1995 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2435  DNA polymerase II large subunit  41.97 
 
 		 1286 aa  1082    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1995  DNA polymerase II, large subunit DP2  100 
 
 		 1481 aa  3036    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3690  DNA polymerase II, large subunit DP2  81.59 
 
 		 1222 aa  1669    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0763  DNA polymerase II, large subunit DP2  65.82 
 
 		 1373 aa  1884    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.107961  normal  0.449591 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1619  DNA polymerase II large subunit  65.34 
 
 		 1193 aa  1316    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.710974  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0150  DNA polymerase II large subunit  66 
 
 		 1366 aa  1900    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2254  DNA polymerase II large subunit  43.72 
 
 		 1283 aa  1148    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.413677 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0923  DNA polymerase II large subunit  40.45 
 
 		 1131 aa  717    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0126  DNA polymerase II large subunit  41.4 
 
 		 1307 aa  1102    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1023  DNA polymerase II large subunit  39.41 
 
 		 1131 aa  670    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.770996 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1656  DNA polymerase II large subunit  40.41 
 
 		 1131 aa  719    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2124  DNA polymerase II large subunit  43.35 
 
 		 1285 aa  1154    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2423  DNA polymerase II large subunit  43.91 
 
 		 1185 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1250  DNA polymerase II large subunit  44.46 
 
 		 1109 aa  555  1e-156  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0899  DNA polymerase II large subunit  47.08 
 
 		 1146 aa  546  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1196  DNA polymerase II large subunit  45.19 
 
 		 1131 aa  458  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1141  DNA polymerase II large subunit  45.83 
 
 		 1665 aa  452  1e-125  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1699  DNA polymerase II large subunit  44.54 
 
 		 1141 aa  450  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.672511 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1172  DNA polymerase II, large subunit DP2  43.62 
 
 		 1090 aa  291  5.0000000000000004e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1794  DNA polymerase II large subunit  35.8 
 
 		 1125 aa  247  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  28.65 
 
 		 873 aa  61.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 1412 aa  55.5  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>