25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0150 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2435  DNA polymerase II large subunit  43.8 
 
 		 1286 aa  1115    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1172  DNA polymerase II, large subunit DP2  40.41 
 
 		 1090 aa  708    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1995  DNA polymerase II, large subunit DP2  65.48 
 
 		 1481 aa  1901    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3690  DNA polymerase II, large subunit DP2  70.18 
 
 		 1222 aa  1360    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0763  DNA polymerase II, large subunit DP2  70.14 
 
 		 1373 aa  1932    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.107961  normal  0.449591 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1619  DNA polymerase II large subunit  70.14 
 
 		 1193 aa  1343    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.710974  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0150  DNA polymerase II large subunit  100 
 
 		 1366 aa  2789    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2254  DNA polymerase II large subunit  46.01 
 
 		 1283 aa  1173    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.413677 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0923  DNA polymerase II large subunit  42.46 
 
 		 1131 aa  743    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0126  DNA polymerase II large subunit  45.71 
 
 		 1307 aa  1173    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1023  DNA polymerase II large subunit  42.57 
 
 		 1131 aa  741    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.770996 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1141  DNA polymerase II large subunit  39.21 
 
 		 1665 aa  744    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1196  DNA polymerase II large subunit  41.9 
 
 		 1131 aa  714    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1656  DNA polymerase II large subunit  42.19 
 
 		 1131 aa  733    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2124  DNA polymerase II large subunit  46.83 
 
 		 1285 aa  1191    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1699  DNA polymerase II large subunit  45.37 
 
 		 1141 aa  776    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.672511 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1250  DNA polymerase II large subunit  48.88 
 
 		 1109 aa  864    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2423  DNA polymerase II large subunit  47.98 
 
 		 1185 aa  896    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0899  DNA polymerase II large subunit  47.23 
 
 		 1146 aa  855    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1794  DNA polymerase II large subunit  33.26 
 
 		 1125 aa  523  1e-147  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  30.38 
 
 		 873 aa  67.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  27.5 
 
 		 1412 aa  48.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2478  protein splicing site  28.77 
 
 		 1080 aa  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0781  RNA polymerase Rpb1 domain 5  36.62 
 
 		 907 aa  47  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0893602  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2784  hypothetical protein  30.23 
 
 		 262 aa  46.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>