More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2478 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2478  protein splicing site  100 
 
 
1080 aa  2224    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242027  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.58 
 
 
772 aa  365  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982206  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  85.91 
 
 
311 aa  283  9e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.5 
 
 
321 aa  277  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.5 
 
 
309 aa  277  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.5 
 
 
308 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.5 
 
 
308 aa  275  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.76 
 
 
311 aa  270  8.999999999999999e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  57.87 
 
 
325 aa  256  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  79.17 
 
 
313 aa  251  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2307  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.5 
 
 
311 aa  245  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.15 
 
 
311 aa  241  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.47 
 
 
311 aa  237  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0189  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  57.14 
 
 
316 aa  236  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.496773  decreased coverage  0.00806939 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.22 
 
 
311 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.366265  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  72.48 
 
 
311 aa  235  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14001  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  57.36 
 
 
316 aa  235  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26091  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  69.59 
 
 
313 aa  234  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.14 
 
 
312 aa  233  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193248  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41531  nad-dependent epimerase/dehydratase  71.33 
 
 
514 aa  233  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  69.18 
 
 
319 aa  231  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  71.33 
 
 
311 aa  230  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  69.13 
 
 
326 aa  229  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.53 
 
 
342 aa  228  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1680  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  66.44 
 
 
318 aa  226  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.178648  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03941  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  67.12 
 
 
318 aa  226  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.873071  normal  0.0436557 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.73 
 
 
316 aa  225  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301245  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.23 
 
 
340 aa  225  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.23 
 
 
340 aa  225  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.63 
 
 
319 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.63 
 
 
318 aa  224  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.83 
 
 
319 aa  224  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  0.0304013 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.53 
 
 
348 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115759  hitchhiker  0.00412284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.93 
 
 
324 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.42 
 
 
318 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  67.13 
 
 
314 aa  224  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.83 
 
 
349 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.257537 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.83 
 
 
349 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  70.63 
 
 
320 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.83 
 
 
348 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6047  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.83 
 
 
348 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438767  normal  0.0540302 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.83 
 
 
348 aa  222  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.66 
 
 
315 aa  221  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.75 
 
 
308 aa  221  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  67.13 
 
 
348 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0857049  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02560  UDP-glucuronic acid decarboxylase Uxs1p  53.57 
 
 
410 aa  219  2e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1378  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  67.13 
 
 
348 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280113  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  67.13 
 
 
348 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1288  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  67.13 
 
 
348 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.43 
 
 
347 aa  219  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  67.13 
 
 
348 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0477125  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  67.13 
 
 
348 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.965327  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2263  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  67.13 
 
 
348 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171141  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.83 
 
 
313 aa  218  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.18 
 
 
314 aa  219  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.13 
 
 
318 aa  218  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.43 
 
 
346 aa  218  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.43 
 
 
310 aa  218  5e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  67.13 
 
 
340 aa  218  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  67.13 
 
 
340 aa  218  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.13 
 
 
330 aa  217  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4391  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  67.83 
 
 
350 aa  217  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626317  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.53 
 
 
341 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.13 
 
 
317 aa  216  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.13 
 
 
318 aa  215  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.5 
 
 
318 aa  215  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.03 
 
 
333 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.03 
 
 
333 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.36 
 
 
316 aa  214  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.83 
 
 
322 aa  214  7.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.03 
 
 
315 aa  214  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.34 
 
 
333 aa  214  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1566  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.71 
 
 
319 aa  213  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13324  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0262  sugar nucleotide dehydratase  64.34 
 
 
317 aa  212  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129808  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.64 
 
 
315 aa  212  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3556  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.83 
 
 
321 aa  212  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.43 
 
 
330 aa  212  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.01 
 
 
320 aa  211  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.38 
 
 
309 aa  211  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3060  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  65.03 
 
 
331 aa  209  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0392933  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.64 
 
 
311 aa  208  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.9 
 
 
313 aa  207  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.34 
 
 
326 aa  206  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235622  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  35.39 
 
 
1059 aa  204  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.05 
 
 
311 aa  200  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.84 
 
 
343 aa  197  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.75 
 
 
313 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.94 
 
 
312 aa  192  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.14 
 
 
348 aa  191  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120111  normal  0.224068 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.68 
 
 
348 aa  191  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  62.68 
 
 
337 aa  190  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  62.68 
 
 
337 aa  190  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.75 
 
 
313 aa  190  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.84 
 
 
336 aa  189  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.75 
 
 
313 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.45 
 
 
318 aa  187  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.66 
 
 
346 aa  184  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258351  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.33 
 
 
337 aa  184  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.5321  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0514  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  57.64 
 
 
337 aa  180  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.64 
 
 
337 aa  180  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0779716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>