20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3690 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0126  DNA polymerase II large subunit  44.33 
 
 
1307 aa  799    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1172  DNA polymerase II, large subunit DP2  42.1 
 
 
1090 aa  954    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1995  DNA polymerase II, large subunit DP2  81.6 
 
 
1481 aa  1680    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3690  DNA polymerase II, large subunit DP2  100 
 
 
1222 aa  2483    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0763  DNA polymerase II, large subunit DP2  73.14 
 
 
1373 aa  1402    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.107961  normal  0.449591 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1619  DNA polymerase II large subunit  70.98 
 
 
1193 aa  1749    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.710974  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0150  DNA polymerase II large subunit  69.78 
 
 
1366 aa  1360    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2254  DNA polymerase II large subunit  47.27 
 
 
1283 aa  833    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.413677 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1794  DNA polymerase II large subunit  34.02 
 
 
1125 aa  726    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0923  DNA polymerase II large subunit  45.25 
 
 
1131 aa  1028    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0899  DNA polymerase II large subunit  49.39 
 
 
1146 aa  1193    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1023  DNA polymerase II large subunit  44.84 
 
 
1131 aa  1018    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.770996 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1141  DNA polymerase II large subunit  40.14 
 
 
1665 aa  728    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1196  DNA polymerase II large subunit  44.49 
 
 
1131 aa  1014    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1656  DNA polymerase II large subunit  45.13 
 
 
1131 aa  1022    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2124  DNA polymerase II large subunit  46.04 
 
 
1285 aa  825    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1699  DNA polymerase II large subunit  44.07 
 
 
1141 aa  1014    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.672511 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1250  DNA polymerase II large subunit  49.84 
 
 
1109 aa  1162    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2423  DNA polymerase II large subunit  49.84 
 
 
1185 aa  1226    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2435  DNA polymerase II large subunit  43.76 
 
 
1286 aa  771    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.547756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>